Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MVB12AQ96EY5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MVB12AQ96EY5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms