Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3P25205 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3P25205 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3P25205 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3P25205 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3P25205 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3P25205 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCM3P25205 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM3P25205 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCM3P25205 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3P25205 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3P25205 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCM3P25205 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3P25205 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3P25205 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3P25205 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3P25205 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCM3P25205 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCM3P25205 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCM3P25205 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3P25205 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3P25205 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3P25205 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3P25205 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3P25205 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3P25205 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3P25205 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM3P25205 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3P25205 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3P25205 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3P25205 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3P25205 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM3P25205 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3P25205 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3P25205 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3P25205 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3P25205 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3P25205 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3P25205 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM3P25205 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM3P25205 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM3P25205 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM3P25205 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM3P25205 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM3P25205 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM3P25205 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM3P25205 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM3P25205 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM3P25205 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM3P25205 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM3P25205 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM3P25205 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM3P25205 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM3P25205 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM3P25205 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM3P25205 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM3P25205 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM3P25205 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM3P25205 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM3P25205 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM3P25205 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM3P25205 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM3P25205 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM3P25205 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM3P25205 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM3P25205 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM3P25205 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM3P25205 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM3P25205 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM3P25205 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM3P25205 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM3P25205 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM3P25205 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM3P25205 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM3P25205 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM3P25205 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM3P25205 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM3P25205 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM3P25205 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM3P25205 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM3P25205 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MCM3P25205 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM3P25205 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM3P25205 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM3P25205 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM3P25205 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM3P25205 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM3P25205 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM3P25205 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM3P25205 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM3P25205 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM3P25205 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM3P25205 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM3P25205 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM3P25205 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM3P25205 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM3P25205 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM3P25205 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM3P25205 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM3P25205 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms