Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME2P23368 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME2P23368 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME2P23368 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ME2P23368 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME2P23368 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME2P23368 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME2P23368 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ME2P23368 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ME2P23368 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ME2P23368 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME2P23368 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME2P23368 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME2P23368 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME2P23368 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ME2P23368 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME2P23368 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ME2P23368 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME2P23368 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME2P23368 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME2P23368 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME2P23368 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ME2P23368 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME2P23368 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME2P23368 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ME2P23368 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME2P23368 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME2P23368 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME2P23368 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME2P23368 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME2P23368 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME2P23368 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ME2P23368 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME2P23368 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME2P23368 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME2P23368 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ME2P23368 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME2P23368 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME2P23368 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME2P23368 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME2P23368 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME2P23368 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME2P23368 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ME2P23368 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME2P23368 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ME2P23368 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME2P23368 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME2P23368 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME2P23368 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ME2P23368 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME2P23368 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME2P23368 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME2P23368 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME2P23368 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME2P23368 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME2P23368 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME2P23368 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME2P23368 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ME2P23368 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME2P23368 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME2P23368 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME2P23368 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME2P23368 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME2P23368 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME2P23368 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME2P23368 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME2P23368 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME2P23368 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME2P23368 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME2P23368 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME2P23368 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ME2P23368 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME2P23368 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME2P23368 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME2P23368 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME2P23368 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME2P23368 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME2P23368 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ME2P23368 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME2P23368 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME2P23368 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME2P23368 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME2P23368 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME2P23368 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ME2P23368 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ME2P23368 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ME2P23368 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME2P23368 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME2P23368 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME2P23368 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME2P23368 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME2P23368 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME2P23368 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ME2P23368 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ME2P23368 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ME2P23368 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME2P23368 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME2P23368 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME2P23368 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ME2P23368 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms