Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EPHA1P21709 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EPHA1P21709 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPHA1P21709 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPHA1P21709 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPHA1P21709 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPHA1P21709 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPHA1P21709 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPHA1P21709 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms