Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms