Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VAMP3Q15836 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms