RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225298.11

UTP18-201, Transcript of UTP18, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP18, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18-201ENST00000225298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.08■■■■■ 4.33
UTP18-201ENST00000225298 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.62■■■■□ 3.45
UTP18-201ENST00000225298 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
UTP18-201ENST00000225298 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.85■■■■□ 3.17
UTP18-201ENST00000225298 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.82■■■■□ 3.16
UTP18-201ENST00000225298 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.48■■■■□ 3.11
UTP18-201ENST00000225298 ABCC9O60706 1549 aa34.46■■■■□ 3.11
UTP18-201ENST00000225298 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.36■■■■□ 3.09
UTP18-201ENST00000225298 NACADO15069 1562 aa34.1■■■■□ 3.05
UTP18-201ENST00000225298 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.78■■■■□ 3
UTP18-201ENST00000225298 SCRIBQ14160 1630 aa33.68■■■□□ 2.98
UTP18-201ENST00000225298 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
UTP18-201ENST00000225298 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.94■■■□□ 2.86
UTP18-201ENST00000225298 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
UTP18-201ENST00000225298 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.63■■■□□ 2.81
UTP18-201ENST00000225298 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.61■■■□□ 2.81
UTP18-201ENST00000225298 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.56■■■□□ 2.8
UTP18-201ENST00000225298 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
UTP18-201ENST00000225298 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.48■■■□□ 2.79
UTP18-201ENST00000225298 SMARCA4P51532 1647 aa32.3■■■□□ 2.76
UTP18-201ENST00000225298 WIZO95785 1651 aa32.22■■■□□ 2.75
UTP18-201ENST00000225298 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.97■■■□□ 2.71
UTP18-201ENST00000225298 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
UTP18-201ENST00000225298 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.89■■■□□ 2.7
UTP18-201ENST00000225298 SMARCA2P51531 1590 aa31.78■■■□□ 2.68
UTP18-201ENST00000225298 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.74■■■□□ 2.67
UTP18-201ENST00000225298 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
UTP18-201ENST00000225298 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
UTP18-201ENST00000225298 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.61■■■□□ 2.65
UTP18-201ENST00000225298 NCAPD3P42695 1498 aa31.45■■■□□ 2.63
UTP18-201ENST00000225298 HMGXB3Q12766 1538 aa31.42■■■□□ 2.62
UTP18-201ENST00000225298 TRIM41Q8WV44 630 aa31.4■■■□□ 2.62
UTP18-201ENST00000225298 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.16■■■□□ 2.58
UTP18-201ENST00000225298 ABCC8Q09428 1581 aa30.97■■■□□ 2.55
UTP18-201ENST00000225298 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
UTP18-201ENST00000225298 CFTRP13569 1480 aa30.8■■■□□ 2.52
UTP18-201ENST00000225298 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
UTP18-201ENST00000225298 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.74■■■□□ 2.51
UTP18-201ENST00000225298 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.7■■■□□ 2.5
UTP18-201ENST00000225298 PRDM2Q13029 1718 aa30.62■■■□□ 2.49
UTP18-201ENST00000225298 SYNJ1O43426 1573 aa30.61■■■□□ 2.49
UTP18-201ENST00000225298 EEA1Q15075 1411 aa30.58■■■□□ 2.49
UTP18-201ENST00000225298 TOP2BQ02880 1626 aa30.53■■■□□ 2.48
UTP18-201ENST00000225298 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.47■■■□□ 2.47
UTP18-201ENST00000225298 SOGA1O94964 1423 aa30.46■■■□□ 2.47
UTP18-201ENST00000225298 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.38■■■□□ 2.45
UTP18-201ENST00000225298 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.38■■■□□ 2.45
UTP18-201ENST00000225298 CUX1P39880 1505 aa30.36■■■□□ 2.45
UTP18-201ENST00000225298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.34■■■□□ 2.45
UTP18-201ENST00000225298 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.31■■■□□ 2.44
UTP18-201ENST00000225298 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.28■■■□□ 2.44
UTP18-201ENST00000225298 NESP48681 1621 aa30.26■■■□□ 2.43
UTP18-201ENST00000225298 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.2■■■□□ 2.43
UTP18-201ENST00000225298 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.2■■■□□ 2.42
UTP18-201ENST00000225298 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.15■■■□□ 2.42
UTP18-201ENST00000225298 GOLGA3Q08378 1498 aa30.12■■■□□ 2.41
UTP18-201ENST00000225298 KIF27Q86VH2 1401 aa30.1■■■□□ 2.41
UTP18-201ENST00000225298 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.09■■■□□ 2.41
UTP18-201ENST00000225298 KIF21BO75037 1637 aa30.06■■■□□ 2.4
UTP18-201ENST00000225298 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.06■■■□□ 2.4
UTP18-201ENST00000225298 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
UTP18-201ENST00000225298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.04■■■□□ 2.4
UTP18-201ENST00000225298 TOPBP1Q92547 1522 aa30■■■□□ 2.39
UTP18-201ENST00000225298 CUX2O14529 1486 aa29.92■■■□□ 2.38
UTP18-201ENST00000225298 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.89■■■□□ 2.38
UTP18-201ENST00000225298 CEP162Q5TB80 1403 aa29.88■■■□□ 2.37
UTP18-201ENST00000225298 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
UTP18-201ENST00000225298 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
UTP18-201ENST00000225298 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.85■■■□□ 2.37
UTP18-201ENST00000225298 PRXQ9BXM0 1461 aa29.85■■■□□ 2.37
UTP18-201ENST00000225298 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.84■■■□□ 2.37
UTP18-201ENST00000225298 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.8■■■□□ 2.36
UTP18-201ENST00000225298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.75■■■□□ 2.35
UTP18-201ENST00000225298 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.74■■■□□ 2.35
UTP18-201ENST00000225298 IGF1RP08069 1367 aa29.74■■■□□ 2.35
UTP18-201ENST00000225298 CLIP1P30622 1438 aa29.64■■■□□ 2.34
UTP18-201ENST00000225298 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.64■■■□□ 2.34
UTP18-201ENST00000225298 ERCC6Q03468 1493 aa29.62■■■□□ 2.33
UTP18-201ENST00000225298 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
UTP18-201ENST00000225298 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.61■■■□□ 2.33
UTP18-201ENST00000225298 WDR97A6NE52 1622 aa29.59■■■□□ 2.33
UTP18-201ENST00000225298 WDR62O43379 1518 aa29.52■■■□□ 2.32
UTP18-201ENST00000225298 CUL7Q14999 1698 aa29.52■■■□□ 2.32
UTP18-201ENST00000225298 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.5■■■□□ 2.31
UTP18-201ENST00000225298 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
UTP18-201ENST00000225298 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
UTP18-201ENST00000225298 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.48■■■□□ 2.31
UTP18-201ENST00000225298 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
UTP18-201ENST00000225298 IFT140Q96RY7 1462 aa29.43■■■□□ 2.3
UTP18-201ENST00000225298 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.39■■■□□ 2.3
UTP18-201ENST00000225298 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
UTP18-201ENST00000225298 APLP2Q06481 763 aa29.31■■■□□ 2.28
UTP18-201ENST00000225298 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
UTP18-201ENST00000225298 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.276e-11■■■■□ 21.8
UTP18-201ENST00000225298 GRIN2BQ13224 1484 aa29.25■■■□□ 2.27
UTP18-201ENST00000225298 PBRM1Q86U86 1689 aa29.25■■■□□ 2.27
UTP18-201ENST00000225298 ARAP1Q96P48 1450 aa29.23■■■□□ 2.27
UTP18-201ENST00000225298 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.21■■■□□ 2.27
UTP18-201ENST00000225298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.2■■■□□ 2.27
UTP18-201ENST00000225298 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.17■■■□□ 2.26
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