RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335046.7

UBE2C-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 737 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-202ENST00000335046 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.23■■■■■ 6.11
UBE2C-202ENST00000335046 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.23■■■■■ 5.15
UBE2C-202ENST00000335046 ABCC9O60706 1549 aa45.98■■■■■ 4.95
UBE2C-202ENST00000335046 NACADO15069 1562 aa44.41■■■■■ 4.7
UBE2C-202ENST00000335046 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.4■■■■■ 4.7
UBE2C-202ENST00000335046 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.39■■■■■ 4.7
UBE2C-202ENST00000335046 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
UBE2C-202ENST00000335046 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.26■■■■■ 4.68
UBE2C-202ENST00000335046 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.12■■■■■ 4.65
UBE2C-202ENST00000335046 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.25■■■■■ 4.51
UBE2C-202ENST00000335046 SCRIBQ14160 1630 aa43.03■■■■■ 4.48
UBE2C-202ENST00000335046 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.02■■■■■ 4.48
UBE2C-202ENST00000335046 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.96■■■■■ 4.47
UBE2C-202ENST00000335046 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.68■■■■■ 4.42
UBE2C-202ENST00000335046 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.03■■■■■ 4.32
UBE2C-202ENST00000335046 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
UBE2C-202ENST00000335046 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.62■■■■■ 4.25
UBE2C-202ENST00000335046 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.4■■■■■ 4.22
UBE2C-202ENST00000335046 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
UBE2C-202ENST00000335046 SMARCA4P51532 1647 aa41.23■■■■■ 4.19
UBE2C-202ENST00000335046 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41■■■■■ 4.15
UBE2C-202ENST00000335046 NCAPD3P42695 1498 aa40.99■■■■■ 4.15
UBE2C-202ENST00000335046 SMARCA2P51531 1590 aa40.99■■■■■ 4.15
UBE2C-202ENST00000335046 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.98■■■■■ 4.15
UBE2C-202ENST00000335046 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.88■■■■■ 4.13
UBE2C-202ENST00000335046 HMGXB3Q12766 1538 aa40.77■■■■■ 4.12
UBE2C-202ENST00000335046 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
UBE2C-202ENST00000335046 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
UBE2C-202ENST00000335046 WIZO95785 1651 aa40.52■■■■■ 4.08
UBE2C-202ENST00000335046 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
UBE2C-202ENST00000335046 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.85■■■■□ 3.97
UBE2C-202ENST00000335046 NESP48681 1621 aa39.82■■■■□ 3.96
UBE2C-202ENST00000335046 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.81■■■■□ 3.96
UBE2C-202ENST00000335046 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
UBE2C-202ENST00000335046 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.69■■■■□ 3.94
UBE2C-202ENST00000335046 ERCC6Q03468 1493 aa39.67■■■■□ 3.94
UBE2C-202ENST00000335046 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.62■■■■□ 3.93
UBE2C-202ENST00000335046 CFTRP13569 1480 aa39.59■■■■□ 3.93
UBE2C-202ENST00000335046 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.34■■■■□ 3.89
UBE2C-202ENST00000335046 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.3■■■■□ 3.88
UBE2C-202ENST00000335046 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.24■■■■□ 3.87
UBE2C-202ENST00000335046 CUX2O14529 1486 aa39.23■■■■□ 3.87
UBE2C-202ENST00000335046 PRDM2Q13029 1718 aa39.23■■■■□ 3.87
UBE2C-202ENST00000335046 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
UBE2C-202ENST00000335046 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.14■■■■□ 3.86
UBE2C-202ENST00000335046 WDR62O43379 1518 aa38.99■■■■□ 3.83
UBE2C-202ENST00000335046 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
UBE2C-202ENST00000335046 ABCC8Q09428 1581 aa38.8■■■■□ 3.8
UBE2C-202ENST00000335046 TOPBP1Q92547 1522 aa38.68■■■■□ 3.78
UBE2C-202ENST00000335046 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.66■■■■□ 3.78
UBE2C-202ENST00000335046 IFT140Q96RY7 1462 aa38.44■■■■□ 3.74
UBE2C-202ENST00000335046 CUX1P39880 1505 aa38.43■■■■□ 3.74
UBE2C-202ENST00000335046 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
UBE2C-202ENST00000335046 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.32■■■■□ 3.73
UBE2C-202ENST00000335046 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.29■■■■□ 3.72
UBE2C-202ENST00000335046 SOGA1O94964 1423 aa38.26■■■■□ 3.72
UBE2C-202ENST00000335046 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
UBE2C-202ENST00000335046 TOP2BQ02880 1626 aa38.19■■■■□ 3.7
UBE2C-202ENST00000335046 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.17■■■■□ 3.7
UBE2C-202ENST00000335046 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.16■■■■□ 3.7
UBE2C-202ENST00000335046 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
UBE2C-202ENST00000335046 SYNJ1O43426 1573 aa38.12■■■■□ 3.69
UBE2C-202ENST00000335046 WDR97A6NE52 1622 aa38.02■■■■□ 3.68
UBE2C-202ENST00000335046 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
UBE2C-202ENST00000335046 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.01■■■■□ 3.676e-10■■■■■ 45.2
UBE2C-202ENST00000335046 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.98■■■■□ 3.67
UBE2C-202ENST00000335046 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
UBE2C-202ENST00000335046 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.81■■■■□ 3.64
UBE2C-202ENST00000335046 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.8■■■■□ 3.64
UBE2C-202ENST00000335046 GRIN2BQ13224 1484 aa37.79■■■■□ 3.64
UBE2C-202ENST00000335046 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.75■■■■□ 3.63
UBE2C-202ENST00000335046 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
UBE2C-202ENST00000335046 OSCARQ8IYS5 282 aa37.67■■■■□ 3.62
UBE2C-202ENST00000335046 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.64■■■■□ 3.62
UBE2C-202ENST00000335046 PBRM1Q86U86 1689 aa37.63■■■■□ 3.61
UBE2C-202ENST00000335046 TRIM41Q8WV44 630 aa37.59■■■■□ 3.61
UBE2C-202ENST00000335046 FBLN2P98095 1184 aa37.55■■■■□ 3.6
UBE2C-202ENST00000335046 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.54■■■■□ 3.6
UBE2C-202ENST00000335046 KIF27Q86VH2 1401 aa37.53■■■■□ 3.6
UBE2C-202ENST00000335046 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
UBE2C-202ENST00000335046 SYNJ2O15056 1496 aa37.51■■■■□ 3.59
UBE2C-202ENST00000335046 CHD1O14646 1710 aa37.47■■■■□ 3.59
UBE2C-202ENST00000335046 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.4■■■■□ 3.58
UBE2C-202ENST00000335046 ADAMTS12P58397 1594 aa37.37■■■■□ 3.57
UBE2C-202ENST00000335046 IGF1RP08069 1367 aa37.35■■■■□ 3.57
UBE2C-202ENST00000335046 GRIN2AQ12879 1464 aa37.27■■■■□ 3.56
UBE2C-202ENST00000335046 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.23■■■■□ 3.55
UBE2C-202ENST00000335046 CUL7Q14999 1698 aa37.2■■■■□ 3.55
UBE2C-202ENST00000335046 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.15■■■■□ 3.54
UBE2C-202ENST00000335046 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.14■■■■□ 3.54
UBE2C-202ENST00000335046 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.13■■■■□ 3.53
UBE2C-202ENST00000335046 NUP160Q12769 1436 aa37.11■■■■□ 3.53
UBE2C-202ENST00000335046 CEP170Q5SW79 1584 aa37.03■■■■□ 3.52
UBE2C-202ENST00000335046 EEA1Q15075 1411 aa36.99■■■■□ 3.51
UBE2C-202ENST00000335046 ARHGEF11O15085 1522 aa36.96■■■■□ 3.51
UBE2C-202ENST00000335046 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.94■■■■□ 3.5
UBE2C-202ENST00000335046 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
UBE2C-202ENST00000335046 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
UBE2C-202ENST00000335046 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
UBE2C-202ENST00000335046 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.9■■■■□ 3.5
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