Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP1P29466 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms