RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445895.2

CARNS1-202, Transcript of carnosine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CARNS1, Length 3,971 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARNS1-202ENST00000445895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.53■■■□□ 2.96
CARNS1-202ENST00000445895 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.77■■■□□ 2.52
CARNS1-202ENST00000445895 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CARNS1-202ENST00000445895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.19■■■□□ 2.42
CARNS1-202ENST00000445895 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.51■■■□□ 2.32
CARNS1-202ENST00000445895 HRCP23327 699 aa29.14■■■□□ 2.26
CARNS1-202ENST00000445895 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.09■■■□□ 2.25
CARNS1-202ENST00000445895 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CARNS1-202ENST00000445895 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.91■■■□□ 2.22
CARNS1-202ENST00000445895 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.84■■■□□ 2.21
CARNS1-202ENST00000445895 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.67■■■□□ 2.18
CARNS1-202ENST00000445895 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CARNS1-202ENST00000445895 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CARNS1-202ENST00000445895 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CARNS1-202ENST00000445895 TRIM41Q8WV44 630 aa28.11■■■□□ 2.09
CARNS1-202ENST00000445895 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CARNS1-202ENST00000445895 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CARNS1-202ENST00000445895 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.71■■■□□ 2.03
CARNS1-202ENST00000445895 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CARNS1-202ENST00000445895 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CARNS1-202ENST00000445895 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.49■■□□□ 1.99
CARNS1-202ENST00000445895 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CARNS1-202ENST00000445895 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CARNS1-202ENST00000445895 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CARNS1-202ENST00000445895 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CARNS1-202ENST00000445895 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CARNS1-202ENST00000445895 SCRIBQ14160 1630 aa27.08■■□□□ 1.93
CARNS1-202ENST00000445895 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CARNS1-202ENST00000445895 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CARNS1-202ENST00000445895 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CARNS1-202ENST00000445895 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.99■■□□□ 1.91
CARNS1-202ENST00000445895 NEUROD1Q13562 356 aa26.97■■□□□ 1.91
CARNS1-202ENST00000445895 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CARNS1-202ENST00000445895 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CARNS1-202ENST00000445895 ABCC9O60706 1549 aa26.78■■□□□ 1.88
CARNS1-202ENST00000445895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.76■■□□□ 1.87
CARNS1-202ENST00000445895 APLP2Q06481 763 aa26.68■■□□□ 1.86
CARNS1-202ENST00000445895 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.6■■□□□ 1.85
CARNS1-202ENST00000445895 MYT1Q01538 1121 aa26.55■■□□□ 1.84
CARNS1-202ENST00000445895 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CARNS1-202ENST00000445895 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.35■■□□□ 1.81
CARNS1-202ENST00000445895 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.34■■□□□ 1.81
CARNS1-202ENST00000445895 MIER1Q8N108 512 aa26.31■■□□□ 1.8
CARNS1-202ENST00000445895 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
CARNS1-202ENST00000445895 ITGAEP38570 1179 aa26.25■■□□□ 1.79
CARNS1-202ENST00000445895 CEP162Q5TB80 1403 aa26.23■■□□□ 1.79
CARNS1-202ENST00000445895 WIZO95785 1651 aa26.15■■□□□ 1.78
CARNS1-202ENST00000445895 SOGA1O94964 1423 aa26.15■■□□□ 1.78
CARNS1-202ENST00000445895 ABCC8Q09428 1581 aa26.14■■□□□ 1.77
CARNS1-202ENST00000445895 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.11■■□□□ 1.77
CARNS1-202ENST00000445895 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CARNS1-202ENST00000445895 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.92■■□□□ 1.74
CARNS1-202ENST00000445895 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.91■■□□□ 1.74
CARNS1-202ENST00000445895 BCANQ96GW7 911 aa25.9■■□□□ 1.74
CARNS1-202ENST00000445895 NACADO15069 1562 aa25.79■■□□□ 1.72
CARNS1-202ENST00000445895 CLIP1P30622 1438 aa25.77■■□□□ 1.72
CARNS1-202ENST00000445895 GOLGA3Q08378 1498 aa25.73■■□□□ 1.71
CARNS1-202ENST00000445895 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CARNS1-202ENST00000445895 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
CARNS1-202ENST00000445895 EEA1Q15075 1411 aa25.58■■□□□ 1.69
CARNS1-202ENST00000445895 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CARNS1-202ENST00000445895 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CARNS1-202ENST00000445895 NEFLP07196 543 aa25.53■■□□□ 1.68
CARNS1-202ENST00000445895 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CARNS1-202ENST00000445895 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CARNS1-202ENST00000445895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CARNS1-202ENST00000445895 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CARNS1-202ENST00000445895 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.47■■□□□ 1.67
CARNS1-202ENST00000445895 P3H3Q8IVL6 736 aa25.46■■□□□ 1.67
CARNS1-202ENST00000445895 FKBP8Q14318 412 aa25.43■■□□□ 1.66
CARNS1-202ENST00000445895 KCNH8Q96L42 1107 aa25.42■■□□□ 1.66
CARNS1-202ENST00000445895 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.4■■□□□ 1.66
CARNS1-202ENST00000445895 SMARCA2P51531 1590 aa25.39■■□□□ 1.66
CARNS1-202ENST00000445895 TRIM52Q96A61 297 aa25.36■■□□□ 1.65
CARNS1-202ENST00000445895 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.35■■□□□ 1.65
CARNS1-202ENST00000445895 SMARCA4P51532 1647 aa25.32■■□□□ 1.64
CARNS1-202ENST00000445895 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CARNS1-202ENST00000445895 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.27■■□□□ 1.64
CARNS1-202ENST00000445895 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CARNS1-202ENST00000445895 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.2■■□□□ 1.62
CARNS1-202ENST00000445895 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.2■■□□□ 1.62
CARNS1-202ENST00000445895 ANP32CO43423 234 aa25.17■■□□□ 1.62
CARNS1-202ENST00000445895 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CARNS1-202ENST00000445895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CARNS1-202ENST00000445895 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.11■■□□□ 1.61
CARNS1-202ENST00000445895 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CARNS1-202ENST00000445895 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.06■■□□□ 1.6
CARNS1-202ENST00000445895 SYNJ1O43426 1573 aa25.06■■□□□ 1.6
CARNS1-202ENST00000445895 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-202ENST00000445895 KIF21BO75037 1637 aa25.01■■□□□ 1.59
CARNS1-202ENST00000445895 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.98■■□□□ 1.59
CARNS1-202ENST00000445895 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.97■■□□□ 1.59
CARNS1-202ENST00000445895 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
CARNS1-202ENST00000445895 BCL11AQ9H165 835 aa24.92■■□□□ 1.58
CARNS1-202ENST00000445895 ARID3CA6NKF2 412 aa24.9■■□□□ 1.58
CARNS1-202ENST00000445895 KIF27Q86VH2 1401 aa24.87■■□□□ 1.57
CARNS1-202ENST00000445895 TONSLQ96HA7 1378 aa24.86■■□□□ 1.57
CARNS1-202ENST00000445895 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.85■■□□□ 1.57
CARNS1-202ENST00000445895 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CARNS1-202ENST00000445895 ARAP1Q96P48 1450 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms