Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 211.76□□□□□ -0.532e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 59.82□□□□□ -0.842e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 29.68□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NCBP3-207ENST00000577169 645 ntTSL 1 (best)15.46■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NCBP3-204ENST00000574911 2701 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.063e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NCBP3-205ENST00000575815 4096 ntTSL 27.93□□□□□ -1.143e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.163e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 214.13□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 211.68□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.772e-6■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.312e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 SLC22A4-203ENST00000491257 564 ntTSL 411.11□□□□□ -0.632e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFV2-208ENST00000577703 854 ntTSL 321.44■■□□□ 1.025e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.025e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.665e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 219.2■□□□□ 0.665e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFV2-209ENST00000583375 211 ntTSL 516.58■□□□□ 0.245e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 SNX9-202ENST00000614703 542 ntTSL 410.13□□□□□ -0.795e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.265e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 SNX9-203ENST00000614800 553 ntTSL 46.13□□□□□ -1.435e-9■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)24.02■■□□□ 1.442e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 220.83■□□□□ 0.932e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.792e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 217.97■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 38.55□□□□□ -1.042e-7■■■□□ 17.2
TARDBPQ13148 RAPGEF2-209ENST00000510510 562 ntTSL 48.91□□□□□ -0.987e-7■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 RAPGEF2-210ENST00000511336 582 ntTSL 36.97□□□□□ -1.297e-7■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 HNRNPM-205ENST00000596295 910 ntTSL 317.85■□□□□ 0.454e-17■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 HNRNPM-216ENST00000602219 1809 nt13.57□□□□□ -0.244e-17■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.061e-6■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.071e-6■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.111e-6■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.121e-6■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 RBM10-205ENST00000496012 509 ntTSL 514.62□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.339e-9■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 PIK3CB-213ENST00000493568 2347 ntTSL 25.6□□□□□ -1.519e-9■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 PIK3CB-209ENST00000481749 2396 ntTSL 25.01□□□□□ -1.619e-9■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 PIK3CB-206ENST00000469284 3164 ntTSL 54.73□□□□□ -1.659e-9■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.79e-9■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.669e-15■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.459e-15■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.449e-15■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.159e-15■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.149e-15■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.159e-15■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.199e-15■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 SCAF8-204ENST00000461219 677 ntTSL 520.34■□□□□ 0.853e-6■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 SCAF8-205ENST00000464628 468 ntTSL 512.29□□□□□ -0.443e-6■■■□□ 17.1
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TARDBPQ13148 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.612e-6■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-8■■■□□ 17.1
TARDBPQ13148 SMYD3-213ENST00000488153 653 ntTSL 35.25□□□□□ -1.574e-7■■■□□ 17.1
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TARDBPQ13148 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.891e-7■■■□□ 17
TARDBPQ13148 MED10-202ENST00000503112 925 ntTSL 214.76□□□□□ -0.051e-7■■■□□ 17
TARDBPQ13148 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.476e-7■■■□□ 17
TARDBPQ13148 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 17
TARDBPQ13148 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 17
TARDBPQ13148 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-6■■■□□ 17
TARDBPQ13148 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 17
TARDBPQ13148 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 17
TARDBPQ13148 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-7■■■□□ 17
TARDBPQ13148 HIF1A-AS2-201ENST00000554254 533 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.091e-9■■■□□ 17
TARDBPQ13148 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)5.92□□□□□ -1.461e-9■■■□□ 17
TARDBPQ13148 PTK2-226ENST00000520917 653 ntTSL 414.23□□□□□ -0.135e-11■■■□□ 17
TARDBPQ13148 PTK2-209ENST00000518509 569 ntTSL 47.05□□□□□ -1.285e-11■■■□□ 17
TARDBPQ13148 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.187e-7■■■□□ 17
TARDBPQ13148 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.67e-7■■■□□ 17
TARDBPQ13148 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-13■■■□□ 17
TARDBPQ13148 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.14□□□□□ -0.151e-13■■■□□ 17
TARDBPQ13148 OLA1-203ENST00000392560 711 ntTSL 58.76□□□□□ -1.018e-7■■■□□ 17
TARDBPQ13148 OLA1-208ENST00000462000 656 ntTSL 26.02□□□□□ -1.458e-7■■■□□ 17
TARDBPQ13148 CPED1-205ENST00000443817 1118 ntTSL 1 (best)4.89□□□□□ -1.633e-13■■■□□ 17
TARDBPQ13148 NDEL1-212ENST00000582277 749 ntTSL 35.19□□□□□ -1.584e-7■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 UBAP2-206ENST00000412543 1349 ntTSL 57.88□□□□□ -1.153e-9■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 27.28□□□□□ -1.243e-9■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.253e-9■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.253e-9■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 UBAP2-208ENST00000459988 2628 ntTSL 26.53□□□□□ -1.363e-9■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 UBAP2-210ENST00000480885 4572 ntTSL 23.36□□□□□ -1.873e-9■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 26.21□□□□□ -1.422e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 313.09□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 REV3L-205ENST00000422377 10964 ntTSL 213.66□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 ANKMY2-203ENST00000447802 2599 ntTSL 28.9□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 REV3L-206ENST00000434009 10644 ntTSL 22.53□□□□□ -22e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.932e-6■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-7■■■□□ 16.9
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