RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000200652.3

SLC22A4-201, Transcript of solute carrier family 22 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A4, Length 2,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4-201ENST00000200652 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.02■■■■□ 3.84
SLC22A4-201ENST00000200652 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.55■■■□□ 2.96
SLC22A4-201ENST00000200652 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
SLC22A4-201ENST00000200652 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.62■■■□□ 2.81
SLC22A4-201ENST00000200652 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.19■■■□□ 2.74
SLC22A4-201ENST00000200652 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.15■■■□□ 2.74
SLC22A4-201ENST00000200652 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
SLC22A4-201ENST00000200652 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.44■■■□□ 2.62
SLC22A4-201ENST00000200652 ABCC9O60706 1549 aa31.23■■■□□ 2.59
SLC22A4-201ENST00000200652 SCRIBQ14160 1630 aa31.14■■■□□ 2.58
SLC22A4-201ENST00000200652 NACADO15069 1562 aa31.08■■■□□ 2.57
SLC22A4-201ENST00000200652 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.77■■■□□ 2.52
SLC22A4-201ENST00000200652 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.65■■■□□ 2.5
SLC22A4-201ENST00000200652 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
SLC22A4-201ENST00000200652 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.37■■■□□ 2.45
SLC22A4-201ENST00000200652 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.25■■■□□ 2.43
SLC22A4-201ENST00000200652 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC22A4-201ENST00000200652 WIZO95785 1651 aa30.07■■■□□ 2.4
SLC22A4-201ENST00000200652 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SLC22A4-201ENST00000200652 SMARCA4P51532 1647 aa29.83■■■□□ 2.37
SLC22A4-201ENST00000200652 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.8■■■□□ 2.36
SLC22A4-201ENST00000200652 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC22A4-201ENST00000200652 TRIM41Q8WV44 630 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC22A4-201ENST00000200652 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
SLC22A4-201ENST00000200652 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SLC22A4-201ENST00000200652 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SLC22A4-201ENST00000200652 SMARCA2P51531 1590 aa29.46■■■□□ 2.31
SLC22A4-201ENST00000200652 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.46■■■□□ 2.31
SLC22A4-201ENST00000200652 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.36■■■□□ 2.29
SLC22A4-201ENST00000200652 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
SLC22A4-201ENST00000200652 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.18■■■□□ 2.26
SLC22A4-201ENST00000200652 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC22A4-201ENST00000200652 ABCC8Q09428 1581 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC22A4-201ENST00000200652 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SLC22A4-201ENST00000200652 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.97■■■□□ 2.23
SLC22A4-201ENST00000200652 HRCP23327 699 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC22A4-201ENST00000200652 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SLC22A4-201ENST00000200652 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
SLC22A4-201ENST00000200652 SOGA1O94964 1423 aa28.77■■■□□ 2.2
SLC22A4-201ENST00000200652 NCAPD3P42695 1498 aa28.72■■■□□ 2.19
SLC22A4-201ENST00000200652 HMGXB3Q12766 1538 aa28.71■■■□□ 2.19
SLC22A4-201ENST00000200652 EEA1Q15075 1411 aa28.7■■■□□ 2.18
SLC22A4-201ENST00000200652 SYNJ1O43426 1573 aa28.67■■■□□ 2.18
SLC22A4-201ENST00000200652 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.65■■■□□ 2.18
SLC22A4-201ENST00000200652 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.6■■■□□ 2.17
SLC22A4-201ENST00000200652 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.49■■■□□ 2.15
SLC22A4-201ENST00000200652 CEP162Q5TB80 1403 aa28.44■■■□□ 2.14
SLC22A4-201ENST00000200652 TOP2BQ02880 1626 aa28.43■■■□□ 2.14
SLC22A4-201ENST00000200652 GOLGA3Q08378 1498 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC22A4-201ENST00000200652 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC22A4-201ENST00000200652 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SLC22A4-201ENST00000200652 KIF21BO75037 1637 aa28.33■■■□□ 2.13
SLC22A4-201ENST00000200652 CFTRP13569 1480 aa28.33■■■□□ 2.13
SLC22A4-201ENST00000200652 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SLC22A4-201ENST00000200652 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.32■■■□□ 2.12
SLC22A4-201ENST00000200652 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.22■■■□□ 2.11
SLC22A4-201ENST00000200652 CUX1P39880 1505 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC22A4-201ENST00000200652 PRDM2Q13029 1718 aa28.2■■■□□ 2.1
SLC22A4-201ENST00000200652 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC22A4-201ENST00000200652 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC22A4-201ENST00000200652 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SLC22A4-201ENST00000200652 CLIP1P30622 1438 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC22A4-201ENST00000200652 PRXQ9BXM0 1461 aa27.99■■■□□ 2.07
SLC22A4-201ENST00000200652 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC22A4-201ENST00000200652 KIF27Q86VH2 1401 aa27.96■■■□□ 2.07
SLC22A4-201ENST00000200652 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SLC22A4-201ENST00000200652 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.87■■■□□ 2.05
SLC22A4-201ENST00000200652 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC22A4-201ENST00000200652 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SLC22A4-201ENST00000200652 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.77■■■□□ 2.04
SLC22A4-201ENST00000200652 CUX2O14529 1486 aa27.75■■■□□ 2.03
SLC22A4-201ENST00000200652 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
SLC22A4-201ENST00000200652 NESP48681 1621 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC22A4-201ENST00000200652 IGF1RP08069 1367 aa27.68■■■□□ 2.02
SLC22A4-201ENST00000200652 ARAP1Q96P48 1450 aa27.66■■■□□ 2.02
SLC22A4-201ENST00000200652 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
SLC22A4-201ENST00000200652 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC22A4-201ENST00000200652 APLP2Q06481 763 aa27.64■■■□□ 2.01
SLC22A4-201ENST00000200652 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.6■■■□□ 2.01
SLC22A4-201ENST00000200652 TOPBP1Q92547 1522 aa27.58■■■□□ 2.01
SLC22A4-201ENST00000200652 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.55■■■□□ 2
SLC22A4-201ENST00000200652 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
SLC22A4-201ENST00000200652 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC22A4-201ENST00000200652 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.51■■□□□ 1.99
SLC22A4-201ENST00000200652 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.5■■□□□ 1.99
SLC22A4-201ENST00000200652 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC22A4-201ENST00000200652 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
SLC22A4-201ENST00000200652 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC22A4-201ENST00000200652 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC22A4-201ENST00000200652 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SLC22A4-201ENST00000200652 WDR97A6NE52 1622 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC22A4-201ENST00000200652 CUL7Q14999 1698 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC22A4-201ENST00000200652 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC22A4-201ENST00000200652 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.21■■□□□ 1.95
SLC22A4-201ENST00000200652 MAP3K1Q13233 1512 aa27.17■■□□□ 1.94
SLC22A4-201ENST00000200652 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SLC22A4-201ENST00000200652 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SLC22A4-201ENST00000200652 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.16■■□□□ 1.94
SLC22A4-201ENST00000200652 TIAM1Q13009 1591 aa27.15■■□□□ 1.94
SLC22A4-201ENST00000200652 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms