Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH4Q9P003 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH4Q9P003 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNIH4Q9P003 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms