Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 PNCK-209ENST00000423545 448 ntTSL 419.32■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 PNCK-231ENST00000488994 1437 ntTSL 219.17■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 PNCK-207ENST00000419804 561 ntTSL 418.58■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.269e-8■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 PNCK-210ENST00000425526 725 ntTSL 516.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 MAN1B1-203ENST00000474902 2336 ntTSL 216.56■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 PNCK-217ENST00000460106 586 ntTSL 416.56■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 516.19■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.149e-8■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.089e-8■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 MAN1B1-213ENST00000544448 2090 ntTSL 1 (best)14.77□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 NFE4-201ENST00000420058 1072 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 512.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 NFE4-202ENST00000638942 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 SIN3A-214ENST00000570115 554 ntTSL 411.41□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 SIN3A-204ENST00000562776 590 ntTSL 411.35□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 511.26□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.679e-8■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 AP000561.1-201ENST00000444130 435 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 210.22□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 SIN3A-209ENST00000568190 567 ntTSL 48.62□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 SIN3A-210ENST00000568309 549 ntTSL 48.1□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 SIN3A-211ENST00000568431 565 ntTSL 57.58□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 AC022098.1-203ENST00000592086 449 ntTSL 311.18□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-219ENST00000542099 1119 ntTSL 324.05■■□□□ 1.448e-7■■■■■ 27.8
SLTMQ9NWH9 PTDSS2-205ENST00000526878 3134 ntTSL 212.54□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 27.7
SLTMQ9NWH9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 27.7
SLTMQ9NWH9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 27.7
SLTMQ9NWH9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 27.7
SLTMQ9NWH9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 27.6
SLTMQ9NWH9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 27.6
SLTMQ9NWH9 SPON2-204ENST00000502483 571 ntTSL 425.7■■□□□ 1.73e-9■■■■■ 27.6
SLTMQ9NWH9 SPON2-220ENST00000515004 571 ntTSL 423.09■■□□□ 1.293e-9■■■■■ 27.6
SLTMQ9NWH9 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)22.97■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.97■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)21.78■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 522.81■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 EVPL-203ENST00000587569 6592 ntTSL 218■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 317.55■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 49.28□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 327.47■■□□□ 1.991e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 217.82■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 DNAAF5-205ENST00000440747 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.46■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 27.5
SLTMQ9NWH9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.056e-7■■■■■ 27.4
SLTMQ9NWH9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 27.4
SLTMQ9NWH9 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 523.94■■□□□ 1.422e-8■■■■■ 27.4
SLTMQ9NWH9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 27.4
SLTMQ9NWH9 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 27.4
SLTMQ9NWH9 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 27.4
SLTMQ9NWH9 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 27.4
SLTMQ9NWH9 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 27.4
SLTMQ9NWH9 PRR5-213ENST00000492289 735 ntTSL 319.59■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 MBD1-218ENST00000589541 836 ntTSL 312.18□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 322.54■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 518.73■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 PDXK-213ENST00000472777 460 ntTSL 511.48□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 510.16□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 AL355987.4-202ENST00000459985 1900 ntTSL 224.75■■□□□ 1.553e-9■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 FANCA-221ENST00000566889 2201 ntTSL 1 (best)27.13■■□□□ 1.932e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 FANCA-212ENST00000563513 571 ntTSL 419.46■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 27.2
SLTMQ9NWH9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 27.2
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