Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.043e-19■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 PTBP1-206ENST00000585856 1217 ntTSL 226.5■■□□□ 1.831e-26■□□□□ 11.3
STAU2Q9NUL3 PTBP1-207ENST00000585932 1030 ntTSL 321.13■□□□□ 0.971e-26■□□□□ 11.3
STAU2Q9NUL3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.162e-10■□□□□ 11.3
STAU2Q9NUL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.122e-10■□□□□ 11.3
STAU2Q9NUL3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.082e-10■□□□□ 11.3
STAU2Q9NUL3 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 227.88■■■□□ 2.052e-10■□□□□ 11.3
STAU2Q9NUL3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.872e-10■□□□□ 11.3
STAU2Q9NUL3 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 319.84■□□□□ 0.772e-10■□□□□ 11.3
STAU2Q9NUL3 PPP4R2-203ENST00000470976 1033 ntTSL 227.75■■■□□ 2.035e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 PPP4R2-206ENST00000488810 877 ntTSL 527.13■■□□□ 1.935e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 PPP4R2-205ENST00000482242 771 ntTSL 327.03■■□□□ 1.925e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 15e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.15e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 PPP4R2-204ENST00000476505 323 ntTSL 53.09□□□□□ -1.915e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.938e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 CHDH-203ENST00000481668 631 ntTSL 220.25■□□□□ 0.838e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 CHDH-202ENST00000467802 565 ntTSL 219.98■□□□□ 0.798e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 318.75■□□□□ 0.598e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.18e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.038e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.058e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.328e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.368e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)12.81□□□□□ -0.368e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 MTMR12-202ENST00000280285 4966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.498e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.698e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.74□□□□□ -1.178e-6■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 213.89□□□□□ -0.192e-11■□□□□ 11.1
STAU2Q9NUL3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.97e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 SSR1-205ENST00000475213 446 ntTSL 312.37□□□□□ -0.437e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.127e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.197e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.587e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 217.11■□□□□ 0.336e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.276e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.516e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.68□□□□□ -0.76e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 45.77□□□□□ -1.496e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 CDRT4-202ENST00000520956 470 ntTSL 42.99□□□□□ -1.936e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 51.65□□□□□ -2.156e-7■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.771e-6■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 MTA1-219ENST00000551236 461 ntTSL 312.27□□□□□ -0.454e-8■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 TEX22-202ENST00000548638 508 ntTSL 511.98□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 LINC00511-214ENST00000581801 379 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 LINC00511-210ENST00000580861 467 ntTSL 49.12□□□□□ -0.951e-6■□□□□ 11
STAU2Q9NUL3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.944e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.524e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.124e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 SARS2-203ENST00000455102 1118 ntTSL 213.59□□□□□ -0.234e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 FAM19A5-201ENST00000336769 546 ntTSL 412.22□□□□□ -0.454e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 SARS2-213ENST00000600448 536 ntTSL 311.95□□□□□ -0.54e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.293e-8■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 222.66■■□□□ 1.223e-8■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.43e-8■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.363e-8■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 514.98□□□□□ -0.013e-8■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-8■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 410.37□□□□□ -0.753e-8■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.18e-9■□□□□ 10.9
STAU2Q9NUL3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.299e-7■□□□□ 10.8
STAU2Q9NUL3 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 532.22■■■□□ 2.756e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.731e-8■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.51e-8■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.391e-8■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 323.1■■□□□ 1.291e-8■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.221e-8■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-209ENST00000574970 570 ntTSL 421.59■■□□□ 1.056e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 219.85■□□□□ 0.776e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 419.72■□□□□ 0.756e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.76e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 419.34■□□□□ 0.696e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.436e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.416e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.386e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 MGST2-203ENST00000503816 1780 ntTSL 517.38■□□□□ 0.376e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.376e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-210ENST00000576925 611 ntTSL 217.01■□□□□ 0.316e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.316e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 516.8■□□□□ 0.285e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 416.73■□□□□ 0.276e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.216e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 316.22■□□□□ 0.196e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 216.15■□□□□ 0.186e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 515.62■□□□□ 0.091e-8■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 SLC25A10-204ENST00000570310 595 ntTSL 315.11■□□□□ 0.016e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 SLC25A10-206ENST00000573246 898 ntTSL 314.38□□□□□ -0.116e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 513.53□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 412.48□□□□□ -0.415e-6■□□□□ 10.7
STAU2Q9NUL3 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 511.43□□□□□ -0.585e-6■□□□□ 10.7
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