Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A3Q92570 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A3Q92570 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1741.7 ms