Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF555Q8NEP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF555Q8NEP9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF555Q8NEP9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF555Q8NEP9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms