Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 PRDX4-205ENST00000495599 632 ntTSL 317.61■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 31.1
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SND1Q7KZF4 PRKCSH-215ENST00000592435 358 ntTSL 510□□□□□ -0.813e-20■■■■■ 31
SND1Q7KZF4 SDF2L1-202ENST00000466935 601 ntTSL 225.84■■□□□ 1.731e-9■■■■■ 31
SND1Q7KZF4 GPC1-207ENST00000466624 782 ntTSL 216.64■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 31
SND1Q7KZF4 MPDU1-225ENST00000584479 572 ntTSL 28.2□□□□□ -1.15e-9■■■■■ 31
SND1Q7KZF4 TGFBI-202ENST00000503087 399 ntTSL 34.55□□□□□ -1.684e-14■■■■■ 31
SND1Q7KZF4 SLC11A2-216ENST00000548554 434 ntTSL 39.32□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 VWA1-204ENST00000495558 819 ntTSL 215.55■□□□□ 0.089e-10■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 CTSS-204ENST00000480760 650 ntTSL 37.82□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 CTSH-215ENST00000534237 691 ntTSL 311.52□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 30.9
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SND1Q7KZF4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.117e-7■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 PRDX4-203ENST00000379349 815 ntTSL 312.54□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 30.9
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SND1Q7KZF4 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-17■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.652e-17■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-17■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-17■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 515.93■□□□□ 0.142e-17■■■■■ 30.9
SND1Q7KZF4 TMPPE-201ENST00000342462 3962 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 30.8
SND1Q7KZF4 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 30.8
SND1Q7KZF4 FADS2-204ENST00000517312 588 ntTSL 514.79□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 30.8
SND1Q7KZF4 FADS2-206ENST00000518606 510 ntTSL 47.51□□□□□ -1.213e-7■■■■■ 30.8
SND1Q7KZF4 SLC3A2-212ENST00000538682 1368 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.066e-15■■■■■ 30.7
SND1Q7KZF4 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-14■■■■■ 30.7
SND1Q7KZF4 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 30.7
SND1Q7KZF4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 30.7
SND1Q7KZF4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 30.7
SND1Q7KZF4 F11R-205ENST00000602966 558 ntTSL 415.58■□□□□ 0.085e-11■■■■■ 30.7
SND1Q7KZF4 RPN1-203ENST00000479113 558 ntTSL 45.38□□□□□ -1.554e-9■■■■■ 30.7
SND1Q7KZF4 MAGT1-202ENST00000373336 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 30.7
SND1Q7KZF4 TMED10-206ENST00000557670 917 ntTSL 210.01□□□□□ -0.815e-8■■■■■ 30.6
SND1Q7KZF4 TMED10-205ENST00000556969 1314 ntTSL 28.49□□□□□ -1.055e-8■■■■■ 30.6
SND1Q7KZF4 TMED10-202ENST00000555036 888 ntTSL 1 (best)6.97□□□□□ -1.295e-8■■■■■ 30.6
SND1Q7KZF4 RDH11-211ENST00000557726 621 ntTSL 313.2□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 30.6
SND1Q7KZF4 CALR-205ENST00000587486 957 ntTSL 217.24■□□□□ 0.358e-26■■■■■ 30.6
SND1Q7KZF4 COCH-204ENST00000468826 2129 ntTSL 27.57□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 30.5
SND1Q7KZF4 ZMPSTE24-202ENST00000472583 537 ntTSL 417.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 30.5
SND1Q7KZF4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 30.5
SND1Q7KZF4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 30.5
SND1Q7KZF4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 30.5
SND1Q7KZF4 SLC38A2-204ENST00000548111 583 ntTSL 410.05□□□□□ -0.83e-22■■■■■ 30.5
SND1Q7KZF4 SERPINA7-203ENST00000487487 395 ntTSL 36.65□□□□□ -1.345e-10■■■■■ 30.5
SND1Q7KZF4 CADM4-202ENST00000593506 302 ntTSL 313.65□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 30.5
SND1Q7KZF4 PNPLA6-205ENST00000593924 584 ntTSL 422.75■■□□□ 1.233e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 PNPLA6-223ENST00000601668 753 ntTSL 320.68■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 CRELD2-211ENST00000498354 525 ntTSL 418.18■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 ITIH5-206ENST00000473591 782 ntTSL 317.89■□□□□ 0.453e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 COL2A1-206ENST00000483376 641 ntTSL 516.87■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MRPS28-204ENST00000519120 403 ntTSL 216.24■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MCAM-202ENST00000524940 206 ntTSL 314.96□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 KRT8-209ENST00000547176 250 ntTSL 514.25□□□□□ -0.132e-15■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 ITIH5-208ENST00000492668 822 ntTSL 212.85□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 30.4
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SND1Q7KZF4 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MRPS28-206ENST00000520946 411 ntTSL 511.95□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MRPS28-208ENST00000521605 437 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 ATP2B4-202ENST00000356729 613 ntTSL 59.6□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 ATP2B4-205ENST00000458092 429 ntTSL 39.6□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MRPS28-207ENST00000521434 585 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MRPS28-205ENST00000519386 555 ntTSL 27.53□□□□□ -1.23e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 ATP2B4-206ENST00000466407 388 ntTSL 37.09□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 CTSD-209ENST00000637158 1200 ntTSL 518.89■□□□□ 0.612e-38■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MESD-202ENST00000422879 1392 ntTSL 217.54■□□□□ 0.49e-9■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.079e-9■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.259e-9■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MESD-207ENST00000619987 3978 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.519e-9■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 MESD-203ENST00000559537 539 ntTSL 410.79□□□□□ -0.689e-9■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 LIPA-204ENST00000428800 1055 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 P4HB-208ENST00000473021 914 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.241e-22■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 COCH-209ENST00000555881 782 ntTSL 222.69■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 HLA-B-250ENST00000434333 863 nt20.68■□□□□ 0.94e-21■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 30.4
SND1Q7KZF4 ALB-215ENST00000510166 532 ntTSL 39.18□□□□□ -0.941e-323■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 ALB-218ENST00000515133 665 ntTSL 28.42□□□□□ -1.061e-323■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 SLC3A2-215ENST00000539891 1300 ntTSL 1 (best)11.17□□□□□ -0.626e-15■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.356e-15■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-209ENST00000489525 1339 ntTSL 525.41■■□□□ 1.667e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.547e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.447e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.427e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-208ENST00000481047 775 ntTSL 223.9■■□□□ 1.427e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.057e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.987e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-212ENST00000533952 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.67■□□□□ 0.97e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.847e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.767e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-210ENST00000490240 603 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.667e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MDK-211ENST00000533283 498 ntTSL 316.14■□□□□ 0.177e-16■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 30.3
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