RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.29■■■■■ 5.64
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.02■■■■■ 4.8
HLA-B-250ENST00000434333 ABCC9O60706 1549 aa44.72■■■■■ 4.75
HLA-B-250ENST00000434333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.69■■■■■ 4.42
HLA-B-250ENST00000434333 NACADO15069 1562 aa42.48■■■■■ 4.39
HLA-B-250ENST00000434333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.18■■■■■ 4.34
HLA-B-250ENST00000434333 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.01■■■■■ 4.32
HLA-B-250ENST00000434333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.79■■■■■ 4.28
HLA-B-250ENST00000434333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
HLA-B-250ENST00000434333 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.75■■■■■ 4.27
HLA-B-250ENST00000434333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.26
HLA-B-250ENST00000434333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.57■■■■■ 4.25
HLA-B-250ENST00000434333 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.51■■■■■ 4.24
HLA-B-250ENST00000434333 SCRIBQ14160 1630 aa41.01■■■■■ 4.16
HLA-B-250ENST00000434333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.94■■■■■ 4.14
HLA-B-250ENST00000434333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.44■■■■■ 4.06
HLA-B-250ENST00000434333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
HLA-B-250ENST00000434333 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.26■■■■■ 4.03
HLA-B-250ENST00000434333 NCAPD3P42695 1498 aa39.23■■■■□ 3.87
HLA-B-250ENST00000434333 SMARCA4P51532 1647 aa39.18■■■■□ 3.86
HLA-B-250ENST00000434333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.15■■■■□ 3.86
HLA-B-250ENST00000434333 SMARCA2P51531 1590 aa39.02■■■■□ 3.84
HLA-B-250ENST00000434333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
HLA-B-250ENST00000434333 HMGXB3Q12766 1538 aa38.97■■■■□ 3.83
HLA-B-250ENST00000434333 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.82■■■■□ 3.81
HLA-B-250ENST00000434333 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.77■■■■□ 3.8
HLA-B-250ENST00000434333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
HLA-B-250ENST00000434333 ERCC6Q03468 1493 aa38.54■■■■□ 3.76
HLA-B-250ENST00000434333 NESP48681 1621 aa38.52■■■■□ 3.76
HLA-B-250ENST00000434333 CUX2O14529 1486 aa38.44■■■■□ 3.74
HLA-B-250ENST00000434333 WIZO95785 1651 aa38.3■■■■□ 3.72
HLA-B-250ENST00000434333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.29■■■■□ 3.72
HLA-B-250ENST00000434333 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
HLA-B-250ENST00000434333 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.09■■■■□ 3.69
HLA-B-250ENST00000434333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.04■■■■□ 3.68
HLA-B-250ENST00000434333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
HLA-B-250ENST00000434333 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.02■■■■□ 3.68
HLA-B-250ENST00000434333 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.01■■■■□ 3.68
HLA-B-250ENST00000434333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
HLA-B-250ENST00000434333 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.71■■■■□ 3.63
HLA-B-250ENST00000434333 CFTRP13569 1480 aa37.66■■■■□ 3.62
HLA-B-250ENST00000434333 WDR62O43379 1518 aa37.63■■■■□ 3.61
HLA-B-250ENST00000434333 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.6■■■■□ 3.61
HLA-B-250ENST00000434333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.59■■■■□ 3.61
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.39■■■■□ 3.58
HLA-B-250ENST00000434333 PRDM2Q13029 1718 aa37.32■■■■□ 3.56
HLA-B-250ENST00000434333 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
HLA-B-250ENST00000434333 TOPBP1Q92547 1522 aa36.93■■■■□ 3.5
HLA-B-250ENST00000434333 IFT140Q96RY7 1462 aa36.84■■■■□ 3.49
HLA-B-250ENST00000434333 ABCC8Q09428 1581 aa36.82■■■■□ 3.48
HLA-B-250ENST00000434333 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.81■■■■□ 3.48
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
HLA-B-250ENST00000434333 OSCARQ8IYS5 282 aa36.66■■■■□ 3.46
HLA-B-250ENST00000434333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
HLA-B-250ENST00000434333 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
HLA-B-250ENST00000434333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.45
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM41Q8WV44 630 aa36.48■■■■□ 3.43
HLA-B-250ENST00000434333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.43
HLA-B-250ENST00000434333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
HLA-B-250ENST00000434333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.42■■■■□ 3.42
HLA-B-250ENST00000434333 CUX1P39880 1505 aa36.4■■■■□ 3.42
HLA-B-250ENST00000434333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.37■■■■□ 3.41
HLA-B-250ENST00000434333 SOGA1O94964 1423 aa36.36■■■■□ 3.41
HLA-B-250ENST00000434333 CHD1O14646 1710 aa36.27■■■■□ 3.4
HLA-B-250ENST00000434333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
HLA-B-250ENST00000434333 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.24■■■■□ 3.39
HLA-B-250ENST00000434333 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.24■■■■□ 3.39
HLA-B-250ENST00000434333 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.24■■■■□ 3.39
HLA-B-250ENST00000434333 WDR97A6NE52 1622 aa36.23■■■■□ 3.39
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGEF11O15085 1522 aa36.15■■■■□ 3.38
HLA-B-250ENST00000434333 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.11■■■■□ 3.37
HLA-B-250ENST00000434333 FBLN2P98095 1184 aa36.07■■■■□ 3.36
HLA-B-250ENST00000434333 GRIN2BQ13224 1484 aa36.03■■■■□ 3.36
HLA-B-250ENST00000434333 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
HLA-B-250ENST00000434333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.98■■■■□ 3.35
HLA-B-250ENST00000434333 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.94■■■■□ 3.34
HLA-B-250ENST00000434333 PBRM1Q86U86 1689 aa35.94■■■■□ 3.34
HLA-B-250ENST00000434333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.93■■■■□ 3.34
HLA-B-250ENST00000434333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.9■■■■□ 3.34
HLA-B-250ENST00000434333 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.89■■■■□ 3.34
HLA-B-250ENST00000434333 SYNJ2O15056 1496 aa35.89■■■■□ 3.34
HLA-B-250ENST00000434333 TOP2BQ02880 1626 aa35.88■■■■□ 3.33
HLA-B-250ENST00000434333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
HLA-B-250ENST00000434333 SYNJ1O43426 1573 aa35.86■■■■□ 3.33
HLA-B-250ENST00000434333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.86■■■■□ 3.33
HLA-B-250ENST00000434333 ARAP1Q96P48 1450 aa35.83■■■■□ 3.33
HLA-B-250ENST00000434333 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.79■■■■□ 3.32
HLA-B-250ENST00000434333 ADAMTS12P58397 1594 aa35.63■■■■□ 3.29
HLA-B-250ENST00000434333 GRIN2AQ12879 1464 aa35.59■■■■□ 3.29
HLA-B-250ENST00000434333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.52■■■■□ 3.28
HLA-B-250ENST00000434333 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.49■■■■□ 3.27
HLA-B-250ENST00000434333 NUP160Q12769 1436 aa35.49■■■■□ 3.27
HLA-B-250ENST00000434333 CEP170Q5SW79 1584 aa35.47■■■■□ 3.27
HLA-B-250ENST00000434333 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.35■■■■□ 3.25
HLA-B-250ENST00000434333 SHROOM2Q13796 1616 aa35.31■■■■□ 3.24
HLA-B-250ENST00000434333 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
HLA-B-250ENST00000434333 KIF27Q86VH2 1401 aa35.14■■■■□ 3.22
HLA-B-250ENST00000434333 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.13■■■■□ 3.21
HLA-B-250ENST00000434333 IGF1RP08069 1367 aa35.13■■■■□ 3.21
HLA-B-250ENST00000434333 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
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