Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN4

KRT72, Keratin, type II cytoskeletal 72, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT72Q14CN4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT72Q14CN4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT72Q14CN4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT72Q14CN4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT72Q14CN4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT72Q14CN4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT72Q14CN4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms