Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23AP54725 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD23AP54725 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD23AP54725 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms