Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIPAP38571 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPAP38571 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIPAP38571 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPAP38571 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPAP38571 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPAP38571 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIPAP38571 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LIPAP38571 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPAP38571 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPAP38571 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPAP38571 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPAP38571 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPAP38571 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPAP38571 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPAP38571 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIPAP38571 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPAP38571 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIPAP38571 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPAP38571 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIPAP38571 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPAP38571 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPAP38571 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPAP38571 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPAP38571 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIPAP38571 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPAP38571 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPAP38571 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPAP38571 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LIPAP38571 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LIPAP38571 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIPAP38571 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPAP38571 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPAP38571 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPAP38571 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPAP38571 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPAP38571 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPAP38571 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIPAP38571 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPAP38571 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPAP38571 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPAP38571 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPAP38571 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIPAP38571 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPAP38571 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPAP38571 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPAP38571 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIPAP38571 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIPAP38571 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPAP38571 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIPAP38571 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIPAP38571 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPAP38571 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPAP38571 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPAP38571 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPAP38571 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIPAP38571 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPAP38571 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPAP38571 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIPAP38571 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPAP38571 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPAP38571 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPAP38571 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPAP38571 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPAP38571 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPAP38571 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIPAP38571 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPAP38571 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPAP38571 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPAP38571 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPAP38571 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIPAP38571 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPAP38571 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPAP38571 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPAP38571 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIPAP38571 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms