Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LIPAP38571 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LIPAP38571 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LIPAP38571 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LIPAP38571 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LIPAP38571 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LIPAP38571 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LIPAP38571 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LIPAP38571 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LIPAP38571 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LIPAP38571 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LIPAP38571 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LIPAP38571 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LIPAP38571 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LIPAP38571 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LIPAP38571 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIPAP38571 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIPAP38571 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LIPAP38571 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LIPAP38571 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LIPAP38571 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIPAP38571 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIPAP38571 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LIPAP38571 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LIPAP38571 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIPAP38571 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIPAP38571 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIPAP38571 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LIPAP38571 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LIPAP38571 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LIPAP38571 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LIPAP38571 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIPAP38571 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIPAP38571 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIPAP38571 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LIPAP38571 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIPAP38571 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LIPAP38571 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LIPAP38571 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIPAP38571 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIPAP38571 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIPAP38571 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIPAP38571 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIPAP38571 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIPAP38571 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIPAP38571 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIPAP38571 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIPAP38571 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIPAP38571 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIPAP38571 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIPAP38571 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIPAP38571 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIPAP38571 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LIPAP38571 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LIPAP38571 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIPAP38571 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIPAP38571 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIPAP38571 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LIPAP38571 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIPAP38571 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIPAP38571 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIPAP38571 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIPAP38571 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIPAP38571 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIPAP38571 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIPAP38571 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIPAP38571 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIPAP38571 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIPAP38571 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIPAP38571 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIPAP38571 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIPAP38571 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIPAP38571 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIPAP38571 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIPAP38571 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIPAP38571 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIPAP38571 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIPAP38571 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIPAP38571 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIPAP38571 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIPAP38571 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIPAP38571 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIPAP38571 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIPAP38571 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LIPAP38571 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIPAP38571 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIPAP38571 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIPAP38571 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIPAP38571 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIPAP38571 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIPAP38571 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIPAP38571 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIPAP38571 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIPAP38571 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LIPAP38571 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LIPAP38571 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LIPAP38571 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIPAP38571 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIPAP38571 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIPAP38571 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms