Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBB4AP04350 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4AP04350 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBB4AP04350 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBB4AP04350 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms