Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MRPL43-214ENST00000523148 844 ntTSL 328.24■■■□□ 2.115e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.723e-8■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 POLD2-215ENST00000481763 810 ntTSL 325.74■■□□□ 1.712e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SIRT7-202ENST00000536038 1883 ntTSL 225.24■■□□□ 1.633e-8■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.182e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-213ENST00000493646 897 ntTSL 1 (best)22.04■■□□□ 1.125e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.115e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.045e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.045e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.045e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SIRT7-206ENST00000571832 2511 ntTSL 221.26■□□□□ 0.993e-8■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.822e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.765e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-210ENST00000476012 539 ntTSL 1 (best)18.63■□□□□ 0.575e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.385e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.385e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-209ENST00000448244 727 ntTSL 517.45■□□□□ 0.385e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.352e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.215e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.045e-6■■■□□ 17.6
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PABPC4Q13310 POLD2-210ENST00000463464 707 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SIRT7-211ENST00000572976 2916 ntTSL 213.82□□□□□ -0.23e-8■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATP5G1-209ENST00000514808 359 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.292e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATP5G1-205ENST00000504591 401 ntTSL 212.85□□□□□ -0.352e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 POLD2-208ENST00000456038 665 ntTSL 312.46□□□□□ -0.412e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SIRT7-217ENST00000574992 3445 ntTSL 212.21□□□□□ -0.453e-8■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 FTH1P10-201ENST00000401830 930 ntBASIC9.96□□□□□ -0.823e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.99□□□□□ -1.133e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 NAT10-208ENST00000532555 615 ntTSL 26.24□□□□□ -1.412e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RPL35A-209ENST00000496582 579 ntTSL 28.39□□□□□ -1.072e-39■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.032e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CAV2-214ENST00000495841 787 ntTSL 214.51□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 17.5
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PABPC4Q13310 CAV2-208ENST00000472470 857 ntTSL 1 (best)9.21□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CAV2-209ENST00000477018 1119 ntTSL 1 (best)9.21□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.366e-8■■■□□ 17.5
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PABPC4Q13310 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 06e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 NEDD8-208ENST00000560427 654 ntTSL 215.44■□□□□ 0.066e-9■■■□□ 17.5
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PABPC4Q13310 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.212e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.262e-6■■■□□ 17.5
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PABPC4Q13310 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.654e-6■■■□□ 17.5
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PABPC4Q13310 CDK4-204ENST00000547281 825 ntTSL 319.68■□□□□ 0.744e-12■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CDK4-215ENST00000553237 952 ntTSL 219.23■□□□□ 0.674e-12■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 515.47■□□□□ 0.074e-12■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CDK4-212ENST00000552388 694 ntTSL 315.47■□□□□ 0.074e-12■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CDK4-214ENST00000552862 447 ntTSL 315.45■□□□□ 0.064e-12■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 CDK4-211ENST00000552254 769 ntTSL 210.83□□□□□ -0.684e-12■■■□□ 17.5
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PABPC4Q13310 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.083e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.811e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.896e-35■■■□□ 17.5
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PABPC4Q13310 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.833e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.923e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.833e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.683e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.513e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.513e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.023e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 FAAP20-212ENST00000476803 701 ntTSL 221.96■■□□□ 1.112e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 FAAP20-214ENST00000497675 4478 ntTSL 217■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 TMX2-206ENST00000528110 829 ntTSL 210.08□□□□□ -0.82e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 TMX2-208ENST00000530114 663 ntTSL 39.18□□□□□ -0.942e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.394e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.34e-6■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.194e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.824e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.474e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.384e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 STXBP2-220ENST00000601061 706 ntTSL 324.39■■□□□ 1.496e-8■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-21■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-21■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.132e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 215.02■□□□□ -02e-9■■■□□ 17.5
PABPC4Q13310 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.32e-9■■■□□ 17.5
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