RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481763.1

POLD2-215, Transcript of DNA polymerase delta 2, accessory subunit, humanhuman

TSL 3

Gene POLD2, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2-215ENST00000481763 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.78■■■■■ 6.04
POLD2-215ENST00000481763 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.08■■■■■ 5.13
POLD2-215ENST00000481763 ABCC9O60706 1549 aa46.23■■■■■ 4.99
POLD2-215ENST00000481763 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.42■■■■■ 4.7
POLD2-215ENST00000481763 NACADO15069 1562 aa44.33■■■■■ 4.69
POLD2-215ENST00000481763 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.04■■■■■ 4.64
POLD2-215ENST00000481763 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.01■■■■■ 4.64
POLD2-215ENST00000481763 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
POLD2-215ENST00000481763 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.73■■■■■ 4.59
POLD2-215ENST00000481763 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.48■■■■■ 4.55
POLD2-215ENST00000481763 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.15■■■■■ 4.5
POLD2-215ENST00000481763 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.49
POLD2-215ENST00000481763 SCRIBQ14160 1630 aa42.81■■■■■ 4.44
POLD2-215ENST00000481763 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.8■■■■■ 4.44
POLD2-215ENST00000481763 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.68■■■■■ 4.42
POLD2-215ENST00000481763 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
POLD2-215ENST00000481763 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.88■■■■■ 4.3
POLD2-215ENST00000481763 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.61■■■■■ 4.25
POLD2-215ENST00000481763 SMARCA4P51532 1647 aa41■■■■■ 4.15
POLD2-215ENST00000481763 NCAPD3P42695 1498 aa40.93■■■■■ 4.14
POLD2-215ENST00000481763 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
POLD2-215ENST00000481763 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.87■■■■■ 4.13
POLD2-215ENST00000481763 SMARCA2P51531 1590 aa40.78■■■■■ 4.12
POLD2-215ENST00000481763 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.69■■■■■ 4.1
POLD2-215ENST00000481763 HMGXB3Q12766 1538 aa40.68■■■■■ 4.1
POLD2-215ENST00000481763 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.65■■■■■ 4.1
POLD2-215ENST00000481763 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
POLD2-215ENST00000481763 WIZO95785 1651 aa40.19■■■■■ 4.02
POLD2-215ENST00000481763 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
POLD2-215ENST00000481763 NESP48681 1621 aa39.96■■■■□ 3.99
POLD2-215ENST00000481763 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.87■■■■□ 3.97
POLD2-215ENST00000481763 ERCC6Q03468 1493 aa39.83■■■■□ 3.97
POLD2-215ENST00000481763 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
POLD2-215ENST00000481763 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.68■■■■□ 3.94
POLD2-215ENST00000481763 CUX2O14529 1486 aa39.65■■■■□ 3.94
POLD2-215ENST00000481763 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.57■■■■□ 3.93
POLD2-215ENST00000481763 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.51■■■■□ 3.91
POLD2-215ENST00000481763 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
POLD2-215ENST00000481763 CFTRP13569 1480 aa39.4■■■■□ 3.9
POLD2-215ENST00000481763 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.32■■■■□ 3.89
POLD2-215ENST00000481763 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.28■■■■□ 3.88
POLD2-215ENST00000481763 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.18■■■■□ 3.86
POLD2-215ENST00000481763 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.17■■■■□ 3.86
POLD2-215ENST00000481763 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.15■■■■□ 3.86
POLD2-215ENST00000481763 WDR62O43379 1518 aa39.1■■■■□ 3.85
POLD2-215ENST00000481763 PRDM2Q13029 1718 aa39.1■■■■□ 3.85
POLD2-215ENST00000481763 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
POLD2-215ENST00000481763 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
POLD2-215ENST00000481763 ABCC8Q09428 1581 aa38.55■■■■□ 3.76
POLD2-215ENST00000481763 TOPBP1Q92547 1522 aa38.54■■■■□ 3.76
POLD2-215ENST00000481763 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.48■■■■□ 3.75
POLD2-215ENST00000481763 IFT140Q96RY7 1462 aa38.37■■■■□ 3.73
POLD2-215ENST00000481763 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
POLD2-215ENST00000481763 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
POLD2-215ENST00000481763 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
POLD2-215ENST00000481763 CUX1P39880 1505 aa38.15■■■■□ 3.7
POLD2-215ENST00000481763 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
POLD2-215ENST00000481763 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
POLD2-215ENST00000481763 SOGA1O94964 1423 aa38.01■■■■□ 3.68
POLD2-215ENST00000481763 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.01■■■■□ 3.67
POLD2-215ENST00000481763 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.96■■■■□ 3.671e-6■■■■■ 29.6
POLD2-215ENST00000481763 OSCARQ8IYS5 282 aa37.9■■■■□ 3.66
POLD2-215ENST00000481763 WDR97A6NE52 1622 aa37.9■■■■□ 3.66
POLD2-215ENST00000481763 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
POLD2-215ENST00000481763 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.77■■■■□ 3.64
POLD2-215ENST00000481763 TOP2BQ02880 1626 aa37.76■■■■□ 3.63
POLD2-215ENST00000481763 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.75■■■■□ 3.63
POLD2-215ENST00000481763 SYNJ1O43426 1573 aa37.7■■■■□ 3.63
POLD2-215ENST00000481763 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.7■■■■□ 3.63
POLD2-215ENST00000481763 CHD1O14646 1710 aa37.64■■■■□ 3.62
POLD2-215ENST00000481763 GRIN2BQ13224 1484 aa37.62■■■■□ 3.61
POLD2-215ENST00000481763 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.58■■■■□ 3.61
POLD2-215ENST00000481763 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.58■■■■□ 3.61
POLD2-215ENST00000481763 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.58■■■■□ 3.61
POLD2-215ENST00000481763 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
POLD2-215ENST00000481763 PBRM1Q86U86 1689 aa37.53■■■■□ 3.6
POLD2-215ENST00000481763 FBLN2P98095 1184 aa37.44■■■■□ 3.58
POLD2-215ENST00000481763 SYNJ2O15056 1496 aa37.42■■■■□ 3.58
POLD2-215ENST00000481763 TRIM41Q8WV44 630 aa37.39■■■■□ 3.58
POLD2-215ENST00000481763 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
POLD2-215ENST00000481763 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.36■■■■□ 3.57
POLD2-215ENST00000481763 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.36■■■■□ 3.57
POLD2-215ENST00000481763 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.36■■■■□ 3.57
POLD2-215ENST00000481763 ARHGEF11O15085 1522 aa37.31■■■■□ 3.56
POLD2-215ENST00000481763 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.27■■■■□ 3.56
POLD2-215ENST00000481763 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.25■■■■□ 3.55
POLD2-215ENST00000481763 ADAMTS12P58397 1594 aa37.21■■■■□ 3.55
POLD2-215ENST00000481763 GRIN2AQ12879 1464 aa37.13■■■■□ 3.54
POLD2-215ENST00000481763 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.13■■■■□ 3.53
POLD2-215ENST00000481763 NUP160Q12769 1436 aa37.02■■■■□ 3.52
POLD2-215ENST00000481763 ARAP1Q96P48 1450 aa37■■■■□ 3.51
POLD2-215ENST00000481763 KIF27Q86VH2 1401 aa36.98■■■■□ 3.51
POLD2-215ENST00000481763 CEP170Q5SW79 1584 aa36.97■■■■□ 3.51
POLD2-215ENST00000481763 IGF1RP08069 1367 aa36.93■■■■□ 3.5
POLD2-215ENST00000481763 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.91■■■■□ 3.5
POLD2-215ENST00000481763 CUL7Q14999 1698 aa36.83■■■■□ 3.49
POLD2-215ENST00000481763 SHROOM2Q13796 1616 aa36.81■■■■□ 3.48
POLD2-215ENST00000481763 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.7■■■■□ 3.46
POLD2-215ENST00000481763 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.68■■■■□ 3.46
POLD2-215ENST00000481763 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.66■■■■□ 3.46
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