Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRIPQ8WXE1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms