RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372870.5

SLC27A4-202, Transcript of solute carrier family 27 member 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC27A4, Length 1,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4-202ENST00000372870 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.96■■■■■ 5.11
SLC27A4-202ENST00000372870 ABCC9O60706 1549 aa42.4■■■■■ 4.38
SLC27A4-202ENST00000372870 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.19■■■■■ 4.34
SLC27A4-202ENST00000372870 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.24■■■■■ 4.03
SLC27A4-202ENST00000372870 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.93■■■■□ 3.98
SLC27A4-202ENST00000372870 NACADO15069 1562 aa39.92■■■■□ 3.98
SLC27A4-202ENST00000372870 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.74■■■■□ 3.95
SLC27A4-202ENST00000372870 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.46■■■■□ 3.91
SLC27A4-202ENST00000372870 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.37■■■■□ 3.89
SLC27A4-202ENST00000372870 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.3■■■■□ 3.88
SLC27A4-202ENST00000372870 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.11■■■■□ 3.85
SLC27A4-202ENST00000372870 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
SLC27A4-202ENST00000372870 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.75■■■■□ 3.79
SLC27A4-202ENST00000372870 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.51■■■■□ 3.75
SLC27A4-202ENST00000372870 SCRIBQ14160 1630 aa38.48■■■■□ 3.75
SLC27A4-202ENST00000372870 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.28■■■■□ 3.72
SLC27A4-202ENST00000372870 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
SLC27A4-202ENST00000372870 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
SLC27A4-202ENST00000372870 NCAPD3P42695 1498 aa36.86■■■■□ 3.49
SLC27A4-202ENST00000372870 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.74■■■■□ 3.47
SLC27A4-202ENST00000372870 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.73■■■■□ 3.47
SLC27A4-202ENST00000372870 SMARCA4P51532 1647 aa36.67■■■■□ 3.46
SLC27A4-202ENST00000372870 SMARCA2P51531 1590 aa36.61■■■■□ 3.45
SLC27A4-202ENST00000372870 ERCC6Q03468 1493 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC27A4-202ENST00000372870 HMGXB3Q12766 1538 aa36.58■■■■□ 3.45
SLC27A4-202ENST00000372870 CUX2O14529 1486 aa36.56■■■■□ 3.44
SLC27A4-202ENST00000372870 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
SLC27A4-202ENST00000372870 NESP48681 1621 aa36.39■■■■□ 3.42
SLC27A4-202ENST00000372870 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
SLC27A4-202ENST00000372870 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.3■■■■□ 3.4
SLC27A4-202ENST00000372870 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.21■■■■□ 3.39
SLC27A4-202ENST00000372870 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.06■■■■□ 3.36
SLC27A4-202ENST00000372870 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
SLC27A4-202ENST00000372870 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.91■■■■□ 3.34
SLC27A4-202ENST00000372870 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC27A4-202ENST00000372870 WIZO95785 1651 aa35.77■■■■□ 3.32
SLC27A4-202ENST00000372870 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC27A4-202ENST00000372870 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.57■■■■□ 3.28
SLC27A4-202ENST00000372870 WDR62O43379 1518 aa35.49■■■■□ 3.27
SLC27A4-202ENST00000372870 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC27A4-202ENST00000372870 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
SLC27A4-202ENST00000372870 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC27A4-202ENST00000372870 CFTRP13569 1480 aa35.31■■■■□ 3.24
SLC27A4-202ENST00000372870 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
SLC27A4-202ENST00000372870 TRIM41Q8WV44 630 aa35.1■■■■□ 3.21
SLC27A4-202ENST00000372870 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
SLC27A4-202ENST00000372870 PRDM2Q13029 1718 aa34.94■■■■□ 3.18
SLC27A4-202ENST00000372870 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.89■■■■□ 3.18
SLC27A4-202ENST00000372870 OSCARQ8IYS5 282 aa34.87■■■■□ 3.17
SLC27A4-202ENST00000372870 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
SLC27A4-202ENST00000372870 IFT140Q96RY7 1462 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC27A4-202ENST00000372870 TOPBP1Q92547 1522 aa34.67■■■■□ 3.14
SLC27A4-202ENST00000372870 ABCC8Q09428 1581 aa34.54■■■■□ 3.12
SLC27A4-202ENST00000372870 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.52■■■■□ 3.12
SLC27A4-202ENST00000372870 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
SLC27A4-202ENST00000372870 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC27A4-202ENST00000372870 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC27A4-202ENST00000372870 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC27A4-202ENST00000372870 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
SLC27A4-202ENST00000372870 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.09
SLC27A4-202ENST00000372870 ARHGEF11O15085 1522 aa34.34■■■■□ 3.09
SLC27A4-202ENST00000372870 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SLC27A4-202ENST00000372870 CHD1O14646 1710 aa34.26■■■■□ 3.07
SLC27A4-202ENST00000372870 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.2■■■■□ 3.07
SLC27A4-202ENST00000372870 FBLN2P98095 1184 aa34.15■■■■□ 3.06
SLC27A4-202ENST00000372870 SOGA1O94964 1423 aa34.13■■■■□ 3.05
SLC27A4-202ENST00000372870 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
SLC27A4-202ENST00000372870 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.1■■■■□ 3.05
SLC27A4-202ENST00000372870 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.07■■■■□ 3.04
SLC27A4-202ENST00000372870 CUX1P39880 1505 aa34.02■■■■□ 3.04
SLC27A4-202ENST00000372870 ARAP1Q96P48 1450 aa34■■■■□ 3.03
SLC27A4-202ENST00000372870 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.99■■■■□ 3.03
SLC27A4-202ENST00000372870 WDR97A6NE52 1622 aa33.97■■■■□ 3.03
SLC27A4-202ENST00000372870 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
SLC27A4-202ENST00000372870 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
SLC27A4-202ENST00000372870 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.85■■■■□ 3.01
SLC27A4-202ENST00000372870 GRIN2BQ13224 1484 aa33.85■■■■□ 3.01
SLC27A4-202ENST00000372870 SYNJ1O43426 1573 aa33.8■■■■□ 3
SLC27A4-202ENST00000372870 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
SLC27A4-202ENST00000372870 SYNJ2O15056 1496 aa33.76■■■■□ 3
SLC27A4-202ENST00000372870 PBRM1Q86U86 1689 aa33.73■■■□□ 2.99
SLC27A4-202ENST00000372870 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
SLC27A4-202ENST00000372870 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.72■■■□□ 2.99
SLC27A4-202ENST00000372870 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.66■■■□□ 2.98
SLC27A4-202ENST00000372870 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.64■■■□□ 2.98
SLC27A4-202ENST00000372870 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.48■■■□□ 2.95
SLC27A4-202ENST00000372870 GRIN2AQ12879 1464 aa33.43■■■□□ 2.94
SLC27A4-202ENST00000372870 TOP2BQ02880 1626 aa33.42■■■□□ 2.94
SLC27A4-202ENST00000372870 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.42■■■□□ 2.94
SLC27A4-202ENST00000372870 ADAMTS12P58397 1594 aa33.4■■■□□ 2.94
SLC27A4-202ENST00000372870 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.34■■■□□ 2.93
SLC27A4-202ENST00000372870 CEP170Q5SW79 1584 aa33.34■■■□□ 2.93
SLC27A4-202ENST00000372870 NUP160Q12769 1436 aa33.32■■■□□ 2.92
SLC27A4-202ENST00000372870 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.27■■■□□ 2.92
SLC27A4-202ENST00000372870 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.23■■■□□ 2.91
SLC27A4-202ENST00000372870 SHROOM2Q13796 1616 aa33.19■■■□□ 2.9
SLC27A4-202ENST00000372870 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
SLC27A4-202ENST00000372870 JPH4Q96JJ6 628 aa32.97■■■□□ 2.87
SLC27A4-202ENST00000372870 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.94■■■□□ 2.86
SLC27A4-202ENST00000372870 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
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