Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RCOR3-216ENST00000534478 564 ntTSL 418.7■□□□□ 0.582e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 STAR-204ENST00000522050 748 ntTSL 518.47■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RCOR3-210ENST00000528408 570 ntTSL 217.87■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PANK4-205ENST00000486396 879 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PANK4-202ENST00000435556 2524 ntTSL 217.21■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PANK4-209ENST00000502770 1041 ntTSL 1 (best)15.42■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PANK4-211ENST00000514922 568 ntTSL 215.42■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RCOR3-211ENST00000528926 1497 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 414.44□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RBM33-206ENST00000392761 2934 ntTSL 213.24□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PLK1-206ENST00000564947 553 ntTSL 312.67□□□□□ -0.382e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.482e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 FCHO1-218ENST00000596951 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RBM33-202ENST00000307403 4360 ntTSL 211.07□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RCOR3-214ENST00000533469 540 ntTSL 410.56□□□□□ -0.722e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 LBR-205ENST00000425080 874 ntTSL 310.18□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 STAR-202ENST00000520114 3448 ntTSL 210.06□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-212ENST00000559158 793 ntTSL 39.87□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.953e-14■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.962e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-222ENST00000560710 908 ntTSL 28.88□□□□□ -0.992e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PPIH-206ENST00000461351 527 ntTSL 37.68□□□□□ -1.183e-14■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 26.29□□□□□ -1.42e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.732e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MAPRE3-206ENST00000475633 1160 ntTSL 218.99■□□□□ 0.633e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MAPRE3-209ENST00000494788 574 ntTSL 216.71■□□□□ 0.273e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PKMYT1-208ENST00000572619 495 ntTSL 417.5■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.561e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 C19orf54-208ENST00000598352 546 ntTSL 1 (best)13.79□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.535e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.655e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 PRC1-210ENST00000556972 728 ntTSL 56.72□□□□□ -1.335e-6■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-206ENST00000526248 771 ntTSL 517.58■□□□□ 0.44e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.234e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-216ENST00000530721 796 ntTSL 314.29□□□□□ -0.124e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-218ENST00000532872 737 ntTSL 314.29□□□□□ -0.124e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.174e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 511.46□□□□□ -0.574e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 210.9□□□□□ -0.664e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 310.87□□□□□ -0.674e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 310.87□□□□□ -0.674e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.674e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 59.66□□□□□ -0.864e-12■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-211ENST00000582648 1013 ntTSL 519.91■□□□□ 0.782e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-212ENST00000582788 2004 ntTSL 518.16■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-222ENST00000584908 1316 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.482e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-218ENST00000584450 3730 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.482e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-206ENST00000578373 4523 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-7■■□□□ 11.8
PCBP1Q15365 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.861e-6■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.531e-6■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 516.85■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.314e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.264e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.24e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.114e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)28.26■■■□□ 2.114e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.084e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.084e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.084e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.084e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.084e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.084e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.084e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.084e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.924e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.034e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.794e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.794e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.44e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 515.66■□□□□ 0.14e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 11.7
PCBP1Q15365 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.154e-7■■□□□ 11.7
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 118.9 ms