Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF879B4DU55 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms