RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443090.1

GCSHP5-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 5, humanhuman

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Gene GCSHP5, Length 522 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP5-201ENST00000443090 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.21■■■■■ 5.63
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.12■■■■■ 4.81
GCSHP5-201ENST00000443090 ABCC9O60706 1549 aa45.11■■■■■ 4.81
GCSHP5-201ENST00000443090 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.95■■■■■ 4.47
GCSHP5-201ENST00000443090 NACADO15069 1562 aa42.65■■■■■ 4.42
GCSHP5-201ENST00000443090 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.37■■■■■ 4.37
GCSHP5-201ENST00000443090 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.24■■■■■ 4.35
GCSHP5-201ENST00000443090 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.09■■■■■ 4.33
GCSHP5-201ENST00000443090 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42■■■■■ 4.31
GCSHP5-201ENST00000443090 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.94■■■■■ 4.3
GCSHP5-201ENST00000443090 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.74■■■■■ 4.27
GCSHP5-201ENST00000443090 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
GCSHP5-201ENST00000443090 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.52■■■■■ 4.24
GCSHP5-201ENST00000443090 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.19■■■■■ 4.18
GCSHP5-201ENST00000443090 SCRIBQ14160 1630 aa41.05■■■■■ 4.16
GCSHP5-201ENST00000443090 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.78■■■■■ 4.12
GCSHP5-201ENST00000443090 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.11
GCSHP5-201ENST00000443090 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.65■■■■■ 4.1
GCSHP5-201ENST00000443090 NCAPD3P42695 1498 aa39.37■■■■□ 3.89
GCSHP5-201ENST00000443090 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.24■■■■□ 3.87
GCSHP5-201ENST00000443090 SMARCA4P51532 1647 aa39.19■■■■□ 3.86
GCSHP5-201ENST00000443090 SMARCA2P51531 1590 aa39.12■■■■□ 3.85
GCSHP5-201ENST00000443090 HMGXB3Q12766 1538 aa39.1■■■■□ 3.85
GCSHP5-201ENST00000443090 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
GCSHP5-201ENST00000443090 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.96■■■■□ 3.83
GCSHP5-201ENST00000443090 CUX2O14529 1486 aa38.95■■■■□ 3.83
GCSHP5-201ENST00000443090 ERCC6Q03468 1493 aa38.93■■■■□ 3.82
GCSHP5-201ENST00000443090 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.85■■■■□ 3.81
GCSHP5-201ENST00000443090 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
GCSHP5-201ENST00000443090 NESP48681 1621 aa38.74■■■■□ 3.79
GCSHP5-201ENST00000443090 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.68■■■■□ 3.78
GCSHP5-201ENST00000443090 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.5■■■■□ 3.75
GCSHP5-201ENST00000443090 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
GCSHP5-201ENST00000443090 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.27■■■■□ 3.72
GCSHP5-201ENST00000443090 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.24■■■■□ 3.71
GCSHP5-201ENST00000443090 WIZO95785 1651 aa38.2■■■■□ 3.71
GCSHP5-201ENST00000443090 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.15■■■■□ 3.7
GCSHP5-201ENST00000443090 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.94■■■■□ 3.66
GCSHP5-201ENST00000443090 WDR62O43379 1518 aa37.87■■■■□ 3.65
GCSHP5-201ENST00000443090 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
GCSHP5-201ENST00000443090 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.76■■■■□ 3.63
GCSHP5-201ENST00000443090 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
GCSHP5-201ENST00000443090 CFTRP13569 1480 aa37.73■■■■□ 3.63
GCSHP5-201ENST00000443090 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.71■■■■□ 3.63
GCSHP5-201ENST00000443090 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
GCSHP5-201ENST00000443090 PRDM2Q13029 1718 aa37.36■■■■□ 3.57
GCSHP5-201ENST00000443090 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.29■■■■□ 3.56
GCSHP5-201ENST00000443090 TRIM41Q8WV44 630 aa37.14■■■■□ 3.54
GCSHP5-201ENST00000443090 OSCARQ8IYS5 282 aa37.09■■■■□ 3.53
GCSHP5-201ENST00000443090 IFT140Q96RY7 1462 aa37.02■■■■□ 3.52
GCSHP5-201ENST00000443090 TOPBP1Q92547 1522 aa37■■■■□ 3.51
GCSHP5-201ENST00000443090 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
GCSHP5-201ENST00000443090 ABCC8Q09428 1581 aa36.91■■■■□ 3.5
GCSHP5-201ENST00000443090 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.87■■■■□ 3.49
GCSHP5-201ENST00000443090 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
GCSHP5-201ENST00000443090 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
GCSHP5-201ENST00000443090 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.67■■■■□ 3.46
GCSHP5-201ENST00000443090 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.67■■■■□ 3.46
GCSHP5-201ENST00000443090 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.67■■■■□ 3.46
GCSHP5-201ENST00000443090 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
GCSHP5-201ENST00000443090 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.6■■■■□ 3.45
GCSHP5-201ENST00000443090 ARHGEF11O15085 1522 aa36.55■■■■□ 3.44
GCSHP5-201ENST00000443090 CHD1O14646 1710 aa36.51■■■■□ 3.43
GCSHP5-201ENST00000443090 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.47■■■■□ 3.43
GCSHP5-201ENST00000443090 SOGA1O94964 1423 aa36.42■■■■□ 3.42
GCSHP5-201ENST00000443090 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.37■■■■□ 3.41
GCSHP5-201ENST00000443090 CUX1P39880 1505 aa36.35■■■■□ 3.41
GCSHP5-201ENST00000443090 WDR97A6NE52 1622 aa36.35■■■■□ 3.41
GCSHP5-201ENST00000443090 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
GCSHP5-201ENST00000443090 FBLN2P98095 1184 aa36.28■■■■□ 3.4
GCSHP5-201ENST00000443090 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.24■■■■□ 3.39
GCSHP5-201ENST00000443090 ARAP1Q96P48 1450 aa36.2■■■■□ 3.39
GCSHP5-201ENST00000443090 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.2■■■■□ 3.39
GCSHP5-201ENST00000443090 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
GCSHP5-201ENST00000443090 GRIN2BQ13224 1484 aa36.14■■■■□ 3.38
GCSHP5-201ENST00000443090 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.12■■■■□ 3.37
GCSHP5-201ENST00000443090 SYNJ1O43426 1573 aa36.05■■■■□ 3.36
GCSHP5-201ENST00000443090 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
GCSHP5-201ENST00000443090 SYNJ2O15056 1496 aa36.04■■■■□ 3.36
GCSHP5-201ENST00000443090 PBRM1Q86U86 1689 aa36■■■■□ 3.35
GCSHP5-201ENST00000443090 GAPVD1Q14C86 1478 aa36■■■■□ 3.35
GCSHP5-201ENST00000443090 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
GCSHP5-201ENST00000443090 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.98■■■■□ 3.35
GCSHP5-201ENST00000443090 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.95■■■■□ 3.35
GCSHP5-201ENST00000443090 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.79■■■■□ 3.32
GCSHP5-201ENST00000443090 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
GCSHP5-201ENST00000443090 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.77■■■■□ 3.32
GCSHP5-201ENST00000443090 TOP2BQ02880 1626 aa35.76■■■■□ 3.32
GCSHP5-201ENST00000443090 ADAMTS12P58397 1594 aa35.68■■■■□ 3.3
GCSHP5-201ENST00000443090 GRIN2AQ12879 1464 aa35.68■■■■□ 3.3
GCSHP5-201ENST00000443090 NUP160Q12769 1436 aa35.59■■■■□ 3.29
GCSHP5-201ENST00000443090 CEP170Q5SW79 1584 aa35.57■■■■□ 3.28
GCSHP5-201ENST00000443090 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.55■■■■□ 3.28
GCSHP5-201ENST00000443090 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.53■■■■□ 3.28
GCSHP5-201ENST00000443090 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.52■■■■□ 3.28
GCSHP5-201ENST00000443090 SHROOM2Q13796 1616 aa35.46■■■■□ 3.27
GCSHP5-201ENST00000443090 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
GCSHP5-201ENST00000443090 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.18■■■■□ 3.22
GCSHP5-201ENST00000443090 JPH4Q96JJ6 628 aa35.15■■■■□ 3.22
GCSHP5-201ENST00000443090 IGF1RP08069 1367 aa35.03■■■■□ 3.2
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