RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.43■■■■□ 3.58
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PANX1-201ENST00000227638 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
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PANX1-201ENST00000227638 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.7■■■□□ 2.5
PANX1-201ENST00000227638 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.49■■■□□ 2.47
PANX1-201ENST00000227638 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.19■■■□□ 2.42
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PANX1-201ENST00000227638 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.29■■■□□ 2.28
PANX1-201ENST00000227638 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.19■■■□□ 2.26
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PANX1-201ENST00000227638 SMARCA2P51531 1590 aa28.32■■■□□ 2.12
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PANX1-201ENST00000227638 SOGA1O94964 1423 aa28.19■■■□□ 2.1
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PANX1-201ENST00000227638 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.94■■■□□ 2.06
PANX1-201ENST00000227638 CEP162Q5TB80 1403 aa27.93■■■□□ 2.06
PANX1-201ENST00000227638 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.93■■■□□ 2.06
PANX1-201ENST00000227638 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.88■■■□□ 2.05
PANX1-201ENST00000227638 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PANX1-201ENST00000227638 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PANX1-201ENST00000227638 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
PANX1-201ENST00000227638 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.7■■■□□ 2.03
PANX1-201ENST00000227638 SYNJ1O43426 1573 aa27.7■■■□□ 2.02
PANX1-201ENST00000227638 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
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PANX1-201ENST00000227638 EEA1Q15075 1411 aa27.53■■■□□ 2
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PANX1-201ENST00000227638 NCAPD3P42695 1498 aa27.36■■□□□ 1.97
PANX1-201ENST00000227638 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.33■■□□□ 1.97
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PANX1-201ENST00000227638 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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PANX1-201ENST00000227638 APLP2Q06481 763 aa27.26■■□□□ 1.96
PANX1-201ENST00000227638 TOP2BQ02880 1626 aa27.26■■□□□ 1.95
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PANX1-201ENST00000227638 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
PANX1-201ENST00000227638 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.2■■□□□ 1.94
PANX1-201ENST00000227638 CUX1P39880 1505 aa27.17■■□□□ 1.94
PANX1-201ENST00000227638 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.14■■□□□ 1.94
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PANX1-201ENST00000227638 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.12■■□□□ 1.93
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PANX1-201ENST00000227638 MIER1Q8N108 512 aa27.09■■□□□ 1.93
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PANX1-201ENST00000227638 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.95■■□□□ 1.9
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PANX1-201ENST00000227638 CUX2O14529 1486 aa26.83■■□□□ 1.89
PANX1-201ENST00000227638 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.82■■□□□ 1.88
PANX1-201ENST00000227638 P3H3Q8IVL6 736 aa26.81■■□□□ 1.88
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PANX1-201ENST00000227638 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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PANX1-201ENST00000227638 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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PANX1-201ENST00000227638 PRDM2Q13029 1718 aa26.72■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.7■■□□□ 1.87
PANX1-201ENST00000227638 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.68■■□□□ 1.86
PANX1-201ENST00000227638 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.65■■□□□ 1.86
PANX1-201ENST00000227638 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.62■■□□□ 1.85
PANX1-201ENST00000227638 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.62■■□□□ 1.85
PANX1-201ENST00000227638 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.53■■□□□ 1.84
PANX1-201ENST00000227638 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PANX1-201ENST00000227638 KCNH8Q96L42 1107 aa26.46■■□□□ 1.83
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