Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.027e-7■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.687e-7■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 CDK18-213ENST00000504648 2435 ntTSL 217.3■□□□□ 0.367e-7■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.137e-7■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 CDK18-214ENST00000505932 1509 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.057e-7■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 CDK18-222ENST00000515494 3756 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.77e-7■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 WDR46-239ENST00000489905 1007 ntTSL 516.81■□□□□ 0.285e-6■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 WDR46-233ENST00000461951 669 ntTSL 314.9□□□□□ -0.025e-6■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 WDR46-235ENST00000473611 872 ntTSL 314.9□□□□□ -0.025e-6■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.185e-6■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 PRKCA-204ENST00000583361 519 ntTSL 37.95□□□□□ -1.145e-6■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.251e-6■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.881e-6■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.91e-6■■■■□ 21.7
RBM22Q9NW64 ACAA1-206ENST00000423611 877 ntTSL 320.2■□□□□ 0.824e-8■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 ACAA1-208ENST00000447223 915 ntTSL 315.73■□□□□ 0.114e-8■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 AGFG2-204ENST00000474713 1864 ntTSL 517.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 318.53■□□□□ 0.566e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-29■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-249ENST00000524180 997 ntTSL 514.42□□□□□ -0.12e-29■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 SETD5-206ENST00000413704 3428 ntTSL 27.23□□□□□ -1.256e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 57.01□□□□□ -1.296e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 SETD5-217ENST00000466242 4038 ntTSL 26.47□□□□□ -1.376e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.699e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 XYLB-202ENST00000424034 3484 ntTSL 29.37□□□□□ -0.919e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.514e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 PLXNB1-213ENST00000473996 1034 ntTSL 215.23■□□□□ 0.032e-8■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.219e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.17■□□□□ 0.829e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.739e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.659e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 518.04■□□□□ 0.489e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 SRCAP-205ENST00000483083 5937 ntTSL 210.83□□□□□ -0.685e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 CDT1-202ENST00000562747 735 ntTSL 216.67■□□□□ 0.267e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPF-206ENST00000498176 715 ntTSL 1 (best)22.51■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPF-205ENST00000477108 636 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.21e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.541e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.551e-7■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)19.44■□□□□ 0.72e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.492e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 513.94□□□□□ -0.182e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.242e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 512.29□□□□□ -0.442e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 512.11□□□□□ -0.472e-10■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 TFRC-209ENST00000464368 569 ntTSL 49.68□□□□□ -0.867e-12■■■■□ 21.6
RBM22Q9NW64 FANCI-212ENST00000566895 4663 ntTSL 26.34□□□□□ -1.391e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.61e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.671e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 FANCI-203ENST00000447611 3690 ntTSL 23.48□□□□□ -1.851e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 FANCI-204ENST00000561894 3268 ntTSL 22.68□□□□□ -1.981e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 FANCI-210ENST00000565522 233 ntTSL 50.73□□□□□ -2.291e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 414.95□□□□□ -0.027e-7■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 HGS-206ENST00000571647 2401 nt15.48■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 HGS-202ENST00000570355 735 ntTSL 514.03□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 HGS-211ENST00000573949 461 ntTSL 513.58□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 SRSF3-201ENST00000339436 1518 ntTSL 212.99□□□□□ -0.331e-8■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 SRSF3-204ENST00000613941 595 ntTSL 410.09□□□□□ -0.791e-8■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 RPL35A-208ENST00000485439 677 ntTSL 27.77□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 RPL35A-202ENST00000429437 442 ntTSL 54.68□□□□□ -1.662e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 SNHG1-221ENST00000544983 870 ntTSL 211.92□□□□□ -0.58e-10■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 SNHG1-215ENST00000540904 594 ntTSL 59.31□□□□□ -0.928e-10■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.863e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 220.14■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 21.5
RBM22Q9NW64 CDHR3-212ENST00000487084 834 ntTSL 322.53■■□□□ 1.23e-6■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 CDHR3-210ENST00000474330 1603 ntTSL 520.76■□□□□ 0.913e-6■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-9■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-9■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.122e-9■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.882e-9■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 317.49■□□□□ 0.398e-12■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-211ENST00000504779 792 ntTSL 513.48□□□□□ -0.258e-12■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 ATP2A2-207ENST00000548169 2951 ntTSL 27.69□□□□□ -1.185e-7■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 PRPF40A-206ENST00000471167 333 ntTSL 23.46□□□□□ -1.865e-7■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 PRPF40A-207ENST00000471701 293 ntTSL 20.47□□□□□ -2.335e-7■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-6■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 ZIM2-202ENST00000593931 483 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 ADD1-227ENST00000541051 975 ntTSL 212.59□□□□□ -0.394e-8■■■■□ 21.4
RBM22Q9NW64 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.148e-7■■■■□ 21.3
RBM22Q9NW64 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.118e-7■■■■□ 21.3
RBM22Q9NW64 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 312.12□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 21.3
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