RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487084.1

CDHR3-212, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene CDHR3, Length 834 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-212ENST00000487084 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.63■■■■■ 6.34
CDHR3-212ENST00000487084 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.61■■■■■ 5.37
CDHR3-212ENST00000487084 ABCC9O60706 1549 aa47.93■■■■■ 5.26
CDHR3-212ENST00000487084 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.92■■■■■ 4.94
CDHR3-212ENST00000487084 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.91■■■■■ 4.94
CDHR3-212ENST00000487084 NACADO15069 1562 aa45.79■■■■■ 4.92
CDHR3-212ENST00000487084 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
CDHR3-212ENST00000487084 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.38■■■■■ 4.86
CDHR3-212ENST00000487084 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.12■■■■■ 4.81
CDHR3-212ENST00000487084 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.83■■■■■ 4.77
CDHR3-212ENST00000487084 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.78■■■■■ 4.76
CDHR3-212ENST00000487084 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.52■■■■■ 4.72
CDHR3-212ENST00000487084 SCRIBQ14160 1630 aa44.47■■■■■ 4.71
CDHR3-212ENST00000487084 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.16■■■■■ 4.66
CDHR3-212ENST00000487084 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44■■■■■ 4.63
CDHR3-212ENST00000487084 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
CDHR3-212ENST00000487084 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.29■■■■■ 4.52
CDHR3-212ENST00000487084 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.06■■■■■ 4.48
CDHR3-212ENST00000487084 SMARCA4P51532 1647 aa42.45■■■■■ 4.39
CDHR3-212ENST00000487084 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
CDHR3-212ENST00000487084 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.28■■■■■ 4.36
CDHR3-212ENST00000487084 NCAPD3P42695 1498 aa42.25■■■■■ 4.35
CDHR3-212ENST00000487084 SMARCA2P51531 1590 aa42.21■■■■■ 4.35
CDHR3-212ENST00000487084 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.13■■■■■ 4.33
CDHR3-212ENST00000487084 HMGXB3Q12766 1538 aa42.04■■■■■ 4.32
CDHR3-212ENST00000487084 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.97■■■■■ 4.31
CDHR3-212ENST00000487084 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
CDHR3-212ENST00000487084 WIZO95785 1651 aa41.66■■■■■ 4.26
CDHR3-212ENST00000487084 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
CDHR3-212ENST00000487084 NESP48681 1621 aa41.39■■■■■ 4.22
CDHR3-212ENST00000487084 ERCC6Q03468 1493 aa41.36■■■■■ 4.21
CDHR3-212ENST00000487084 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
CDHR3-212ENST00000487084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.18■■■■■ 4.18
CDHR3-212ENST00000487084 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.05■■■■■ 4.16
CDHR3-212ENST00000487084 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.96■■■■■ 4.15
CDHR3-212ENST00000487084 CUX2O14529 1486 aa40.9■■■■■ 4.14
CDHR3-212ENST00000487084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.85■■■■■ 4.13
CDHR3-212ENST00000487084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CDHR3-212ENST00000487084 CFTRP13569 1480 aa40.74■■■■■ 4.11
CDHR3-212ENST00000487084 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.72■■■■■ 4.11
CDHR3-212ENST00000487084 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.61■■■■■ 4.09
CDHR3-212ENST00000487084 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.58■■■■■ 4.09
CDHR3-212ENST00000487084 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.57■■■■■ 4.08
CDHR3-212ENST00000487084 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
CDHR3-212ENST00000487084 WDR62O43379 1518 aa40.4■■■■■ 4.06
CDHR3-212ENST00000487084 PRDM2Q13029 1718 aa40.36■■■■■ 4.05
CDHR3-212ENST00000487084 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
CDHR3-212ENST00000487084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.93■■■■□ 3.98
CDHR3-212ENST00000487084 TOPBP1Q92547 1522 aa39.92■■■■□ 3.98
CDHR3-212ENST00000487084 ABCC8Q09428 1581 aa39.86■■■■□ 3.97
CDHR3-212ENST00000487084 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.84■■■■□ 3.97
CDHR3-212ENST00000487084 IFT140Q96RY7 1462 aa39.73■■■■□ 3.95
CDHR3-212ENST00000487084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
CDHR3-212ENST00000487084 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
CDHR3-212ENST00000487084 CUX1P39880 1505 aa39.54■■■■□ 3.92
CDHR3-212ENST00000487084 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.46■■■■□ 3.91
CDHR3-212ENST00000487084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
CDHR3-212ENST00000487084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.43■■■■□ 3.9
CDHR3-212ENST00000487084 SOGA1O94964 1423 aa39.42■■■■□ 3.9
CDHR3-212ENST00000487084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
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CDHR3-212ENST00000487084 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
CDHR3-212ENST00000487084 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.23■■■■□ 3.87
CDHR3-212ENST00000487084 OSCARQ8IYS5 282 aa39.22■■■■□ 3.87
CDHR3-212ENST00000487084 SYNJ1O43426 1573 aa39.12■■■■□ 3.85
CDHR3-212ENST00000487084 WDR97A6NE52 1622 aa39.11■■■■□ 3.85
CDHR3-212ENST00000487084 TOP2BQ02880 1626 aa39.11■■■■□ 3.85
CDHR3-212ENST00000487084 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.09■■■■□ 3.85
CDHR3-212ENST00000487084 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.03■■■■□ 3.84
CDHR3-212ENST00000487084 FBLN2P98095 1184 aa39■■■■□ 3.83
CDHR3-212ENST00000487084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.98■■■■□ 3.83
CDHR3-212ENST00000487084 GRIN2BQ13224 1484 aa38.98■■■■□ 3.83
CDHR3-212ENST00000487084 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.95■■■■□ 3.83
CDHR3-212ENST00000487084 CHD1O14646 1710 aa38.94■■■■□ 3.82
CDHR3-212ENST00000487084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
CDHR3-212ENST00000487084 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.88■■■■□ 3.81
CDHR3-212ENST00000487084 PBRM1Q86U86 1689 aa38.85■■■■□ 3.81
CDHR3-212ENST00000487084 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
CDHR3-212ENST00000487084 SYNJ2O15056 1496 aa38.74■■■■□ 3.79
CDHR3-212ENST00000487084 TRIM41Q8WV44 630 aa38.66■■■■□ 3.78
CDHR3-212ENST00000487084 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
CDHR3-212ENST00000487084 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
CDHR3-212ENST00000487084 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
CDHR3-212ENST00000487084 ARHGEF11O15085 1522 aa38.58■■■■□ 3.77
CDHR3-212ENST00000487084 ADAMTS12P58397 1594 aa38.56■■■■□ 3.76
CDHR3-212ENST00000487084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.55■■■■□ 3.76
CDHR3-212ENST00000487084 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.49■■■■□ 3.75
CDHR3-212ENST00000487084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.49■■■■□ 3.75
CDHR3-212ENST00000487084 GRIN2AQ12879 1464 aa38.47■■■■□ 3.75
CDHR3-212ENST00000487084 KIF27Q86VH2 1401 aa38.42■■■■□ 3.74
CDHR3-212ENST00000487084 CEP170Q5SW79 1584 aa38.29■■■■□ 3.72
CDHR3-212ENST00000487084 NUP160Q12769 1436 aa38.29■■■■□ 3.72
CDHR3-212ENST00000487084 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.28■■■■□ 3.72
CDHR3-212ENST00000487084 IGF1RP08069 1367 aa38.26■■■■□ 3.72
CDHR3-212ENST00000487084 ARAP1Q96P48 1450 aa38.25■■■■□ 3.71
CDHR3-212ENST00000487084 CUL7Q14999 1698 aa38.16■■■■□ 3.7
CDHR3-212ENST00000487084 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.06■■■■□ 3.68
CDHR3-212ENST00000487084 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.01■■■■□ 3.67
CDHR3-212ENST00000487084 SHROOM2Q13796 1616 aa37.99■■■■□ 3.67
CDHR3-212ENST00000487084 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.99■■■■□ 3.67
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