RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491163.1

C7orf50-208, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C7orf50, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-208ENST00000491163 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.88■■■■■ 5.41
C7orf50-208ENST00000491163 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.47■■■■■ 4.55
C7orf50-208ENST00000491163 ABCC9O60706 1549 aa42.74■■■■■ 4.43
C7orf50-208ENST00000491163 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.96■■■■■ 4.15
C7orf50-208ENST00000491163 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.94■■■■■ 4.14
C7orf50-208ENST00000491163 NACADO15069 1562 aa40.86■■■■■ 4.13
C7orf50-208ENST00000491163 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
C7orf50-208ENST00000491163 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.52■■■■■ 4.08
C7orf50-208ENST00000491163 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.35■■■■■ 4.05
C7orf50-208ENST00000491163 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.15■■■■■ 4.02
C7orf50-208ENST00000491163 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.98
C7orf50-208ENST00000491163 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.8■■■■□ 3.96
C7orf50-208ENST00000491163 SCRIBQ14160 1630 aa39.8■■■■□ 3.96
C7orf50-208ENST00000491163 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.31■■■■□ 3.88
C7orf50-208ENST00000491163 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.2■■■■□ 3.87
C7orf50-208ENST00000491163 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
C7orf50-208ENST00000491163 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.63■■■■□ 3.77
C7orf50-208ENST00000491163 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.36■■■■□ 3.73
C7orf50-208ENST00000491163 SMARCA4P51532 1647 aa37.98■■■■□ 3.67
C7orf50-208ENST00000491163 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
C7orf50-208ENST00000491163 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.77■■■■□ 3.64
C7orf50-208ENST00000491163 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.73■■■■□ 3.63
C7orf50-208ENST00000491163 NCAPD3P42695 1498 aa37.7■■■■□ 3.63
C7orf50-208ENST00000491163 SMARCA2P51531 1590 aa37.68■■■■□ 3.62
C7orf50-208ENST00000491163 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.55■■■■□ 3.6
C7orf50-208ENST00000491163 HMGXB3Q12766 1538 aa37.54■■■■□ 3.6
C7orf50-208ENST00000491163 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
C7orf50-208ENST00000491163 WIZO95785 1651 aa37.35■■■■□ 3.57
C7orf50-208ENST00000491163 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
C7orf50-208ENST00000491163 NESP48681 1621 aa36.99■■■■□ 3.51
C7orf50-208ENST00000491163 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
C7orf50-208ENST00000491163 ERCC6Q03468 1493 aa36.8■■■■□ 3.48
C7orf50-208ENST00000491163 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.74■■■■□ 3.47
C7orf50-208ENST00000491163 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.62■■■■□ 3.45
C7orf50-208ENST00000491163 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.54■■■■□ 3.44
C7orf50-208ENST00000491163 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.48■■■■□ 3.43
C7orf50-208ENST00000491163 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.46■■■■□ 3.43
C7orf50-208ENST00000491163 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
C7orf50-208ENST00000491163 CFTRP13569 1480 aa36.39■■■■□ 3.42
C7orf50-208ENST00000491163 CUX2O14529 1486 aa36.37■■■■□ 3.41
C7orf50-208ENST00000491163 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
C7orf50-208ENST00000491163 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.25■■■■□ 3.39
C7orf50-208ENST00000491163 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.21■■■■□ 3.39
C7orf50-208ENST00000491163 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.18■■■■□ 3.38
C7orf50-208ENST00000491163 PRDM2Q13029 1718 aa36.16■■■■□ 3.38
C7orf50-208ENST00000491163 WDR62O43379 1518 aa36.06■■■■□ 3.36
C7orf50-208ENST00000491163 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
C7orf50-208ENST00000491163 TOPBP1Q92547 1522 aa35.67■■■■□ 3.3
C7orf50-208ENST00000491163 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.61■■■■□ 3.29
C7orf50-208ENST00000491163 ABCC8Q09428 1581 aa35.52■■■■□ 3.28
C7orf50-208ENST00000491163 IFT140Q96RY7 1462 aa35.41■■■■□ 3.26
C7orf50-208ENST00000491163 CUX1P39880 1505 aa35.41■■■■□ 3.26
C7orf50-208ENST00000491163 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
C7orf50-208ENST00000491163 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
C7orf50-208ENST00000491163 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.35■■■■□ 3.25
C7orf50-208ENST00000491163 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
C7orf50-208ENST00000491163 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.29■■■■□ 3.24
C7orf50-208ENST00000491163 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.27■■■■□ 3.24
C7orf50-208ENST00000491163 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
C7orf50-208ENST00000491163 SOGA1O94964 1423 aa35.18■■■■□ 3.22
C7orf50-208ENST00000491163 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
C7orf50-208ENST00000491163 SYNJ1O43426 1573 aa35.1■■■■□ 3.21
C7orf50-208ENST00000491163 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.09■■■■□ 3.21
C7orf50-208ENST00000491163 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
C7orf50-208ENST00000491163 TOP2BQ02880 1626 aa35.03■■■■□ 3.2
C7orf50-208ENST00000491163 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.03■■■■□ 3.2
C7orf50-208ENST00000491163 WDR97A6NE52 1622 aa35.01■■■■□ 3.19
C7orf50-208ENST00000491163 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.88■■■■□ 3.17
C7orf50-208ENST00000491163 OSCARQ8IYS5 282 aa34.82■■■■□ 3.16
C7orf50-208ENST00000491163 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.82■■■■□ 3.16
C7orf50-208ENST00000491163 CHD1O14646 1710 aa34.81■■■■□ 3.16
C7orf50-208ENST00000491163 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.81■■■■□ 3.16
C7orf50-208ENST00000491163 PBRM1Q86U86 1689 aa34.79■■■■□ 3.16
C7orf50-208ENST00000491163 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.78■■■■□ 3.16
C7orf50-208ENST00000491163 GRIN2BQ13224 1484 aa34.77■■■■□ 3.16
C7orf50-208ENST00000491163 FBLN2P98095 1184 aa34.72■■■■□ 3.15
C7orf50-208ENST00000491163 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
C7orf50-208ENST00000491163 SYNJ2O15056 1496 aa34.57■■■■□ 3.12
C7orf50-208ENST00000491163 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
C7orf50-208ENST00000491163 ADAMTS12P58397 1594 aa34.49■■■■□ 3.11
C7orf50-208ENST00000491163 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.45■■■■□ 3.1
C7orf50-208ENST00000491163 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.4■■■■□ 3.1
C7orf50-208ENST00000491163 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.4■■■■□ 3.1
C7orf50-208ENST00000491163 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.4■■■■□ 3.1
C7orf50-208ENST00000491163 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.38■■■■□ 3.09
C7orf50-208ENST00000491163 ARHGEF11O15085 1522 aa34.36■■■■□ 3.09
C7orf50-208ENST00000491163 GRIN2AQ12879 1464 aa34.36■■■■□ 3.09
C7orf50-208ENST00000491163 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.35■■■■□ 3.09
C7orf50-208ENST00000491163 KIF27Q86VH2 1401 aa34.32■■■■□ 3.08
C7orf50-208ENST00000491163 TRIM41Q8WV44 630 aa34.29■■■■□ 3.08
C7orf50-208ENST00000491163 CEP170Q5SW79 1584 aa34.24■■■■□ 3.07
C7orf50-208ENST00000491163 IGF1RP08069 1367 aa34.22■■■■□ 3.07
C7orf50-208ENST00000491163 NUP160Q12769 1436 aa34.19■■■■□ 3.06
C7orf50-208ENST00000491163 CUL7Q14999 1698 aa34.14■■■■□ 3.06
C7orf50-208ENST00000491163 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.13■■■■□ 3.05
C7orf50-208ENST00000491163 ARAP1Q96P48 1450 aa34.1■■■■□ 3.05
C7orf50-208ENST00000491163 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.03■■■■□ 3.04
C7orf50-208ENST00000491163 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.01■■■■□ 3.04
C7orf50-208ENST00000491163 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.99■■■■□ 3.03
C7orf50-208ENST00000491163 SHROOM2Q13796 1616 aa33.96■■■■□ 3.03
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