Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR3Q9UNL2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSR3Q9UNL2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR3Q9UNL2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR3Q9UNL2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms