Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CROTQ9UKG9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROTQ9UKG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROTQ9UKG9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms