Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CROTQ9UKG9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CROTQ9UKG9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CROTQ9UKG9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CROTQ9UKG9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CROTQ9UKG9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CROTQ9UKG9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CROTQ9UKG9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CROTQ9UKG9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CROTQ9UKG9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CROTQ9UKG9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CROTQ9UKG9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CROTQ9UKG9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CROTQ9UKG9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CROTQ9UKG9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CROTQ9UKG9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CROTQ9UKG9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CROTQ9UKG9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CROTQ9UKG9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CROTQ9UKG9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CROTQ9UKG9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CROTQ9UKG9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CROTQ9UKG9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CROTQ9UKG9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CROTQ9UKG9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CROTQ9UKG9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CROTQ9UKG9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CROTQ9UKG9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CROTQ9UKG9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CROTQ9UKG9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CROTQ9UKG9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CROTQ9UKG9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CROTQ9UKG9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CROTQ9UKG9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CROTQ9UKG9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CROTQ9UKG9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CROTQ9UKG9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CROTQ9UKG9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CROTQ9UKG9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CROTQ9UKG9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CROTQ9UKG9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CROTQ9UKG9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CROTQ9UKG9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CROTQ9UKG9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CROTQ9UKG9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROTQ9UKG9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROTQ9UKG9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROTQ9UKG9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CROTQ9UKG9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CROTQ9UKG9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CROTQ9UKG9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CROTQ9UKG9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CROTQ9UKG9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CROTQ9UKG9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CROTQ9UKG9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CROTQ9UKG9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CROTQ9UKG9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CROTQ9UKG9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CROTQ9UKG9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CROTQ9UKG9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CROTQ9UKG9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CROTQ9UKG9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CROTQ9UKG9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CROTQ9UKG9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CROTQ9UKG9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CROTQ9UKG9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CROTQ9UKG9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CROTQ9UKG9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CROTQ9UKG9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CROTQ9UKG9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CROTQ9UKG9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CROTQ9UKG9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROTQ9UKG9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CROTQ9UKG9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CROTQ9UKG9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CROTQ9UKG9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CROTQ9UKG9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CROTQ9UKG9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CROTQ9UKG9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CROTQ9UKG9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CROTQ9UKG9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CROTQ9UKG9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CROTQ9UKG9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROTQ9UKG9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROTQ9UKG9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROTQ9UKG9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CROTQ9UKG9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CROTQ9UKG9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CROTQ9UKG9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CROTQ9UKG9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CROTQ9UKG9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CROTQ9UKG9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CROTQ9UKG9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CROTQ9UKG9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CROTQ9UKG9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CROTQ9UKG9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CROTQ9UKG9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CROTQ9UKG9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CROTQ9UKG9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CROTQ9UKG9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms