Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZIM3Q96PE6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIM3Q96PE6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIM3Q96PE6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZIM3Q96PE6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms