Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.158e-7■■■■■ 27.9
FUBP3Q96I24 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.158e-7■■■■■ 27.9
FUBP3Q96I24 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 LPCAT4-205ENST00000563748 1357 ntTSL 216.91■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 BRMS1L-205ENST00000552677 1544 ntTSL 213.58□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 AL022722.1-201ENST00000406333 582 ntBASIC12.16□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 NR2C2-209ENST00000439011 698 ntTSL 310.69□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 NR2C2-205ENST00000413194 551 ntTSL 36.81□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 BRMS1L-204ENST00000551774 1201 ntTSL 1 (best)5.65□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.564e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-22■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.343e-22■■■■■ 27.8
FUBP3Q96I24 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.819e-11■■■■■ 27.7
FUBP3Q96I24 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 27.6
FUBP3Q96I24 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 27.6
FUBP3Q96I24 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 27.6
FUBP3Q96I24 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.178e-16■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.18e-16■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.258e-16■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 TMED7-TICAM2-203ENST00000514548 736 ntTSL 26.76□□□□□ -1.338e-16■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.324e-11■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.434e-11■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.854e-11■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.314e-12■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.324e-12■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.684e-12■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.874e-12■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 LIN54-205ENST00000505905 810 ntTSL 26.95□□□□□ -1.34e-12■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-211ENST00000543154 582 ntTSL 29.01□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-206ENST00000538845 663 ntTSL 55.72□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-202ENST00000536375 790 ntTSL 55.67□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-204ENST00000537695 568 ntTSL 44.97□□□□□ -1.611e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-208ENST00000539994 562 ntTSL 44.79□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-213ENST00000543415 907 ntTSL 54.76□□□□□ -1.651e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-209ENST00000542279 552 ntTSL 54.69□□□□□ -1.661e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 GTF2H3-205ENST00000538533 555 ntTSL 54.48□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 27.5
FUBP3Q96I24 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.697e-10■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.097e-10■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.157e-10■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 211.6□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.752e-6■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 SP3-202ENST00000416195 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 SP3-205ENST00000465379 5489 ntTSL 1 (best)4.11□□□□□ -1.753e-7■■■■■ 27.4
FUBP3Q96I24 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 27.3
FUBP3Q96I24 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 27.3
FUBP3Q96I24 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.47e-7■■■■■ 27.3
FUBP3Q96I24 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.57e-7■■■■■ 27.3
FUBP3Q96I24 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 27.2
FUBP3Q96I24 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 27.2
FUBP3Q96I24 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 27.2
FUBP3Q96I24 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 27.1
FUBP3Q96I24 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.44e-9■■■■■ 27.1
FUBP3Q96I24 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 27.1
FUBP3Q96I24 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 27
FUBP3Q96I24 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 27
FUBP3Q96I24 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 26.9
FUBP3Q96I24 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 26.9
FUBP3Q96I24 TOX3-204ENST00000566696 3414 ntTSL 25.65□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 26.9
FUBP3Q96I24 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 26.9
FUBP3Q96I24 MED13L-208ENST00000552023 413 ntTSL 37.05□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 26.9
FUBP3Q96I24 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.612e-18■■■■■ 26.9
FUBP3Q96I24 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 26.8
FUBP3Q96I24 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 26.8
FUBP3Q96I24 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 26.8
FUBP3Q96I24 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.684e-9■■■■□ 26.7
FUBP3Q96I24 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-12■■■■□ 26.6
FUBP3Q96I24 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-12■■■■□ 26.6
FUBP3Q96I24 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-12■■■■□ 26.6
FUBP3Q96I24 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.918e-7■■■■□ 26.5
FUBP3Q96I24 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.268e-7■■■■□ 26.5
FUBP3Q96I24 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-9■■■■□ 26.5
FUBP3Q96I24 TMEM2-204ENST00000377057 2637 ntTSL 29.8□□□□□ -0.841e-9■■■■□ 26.5
FUBP3Q96I24 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.651e-12■■■■□ 26.4
FUBP3Q96I24 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-12■■■■□ 26.4
FUBP3Q96I24 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-12■■■■□ 26.4
FUBP3Q96I24 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-12■■■■□ 26.4
FUBP3Q96I24 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.221e-12■■■■□ 26.4
FUBP3Q96I24 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.421e-12■■■■□ 26.4
FUBP3Q96I24 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-12■■■■□ 26.4
FUBP3Q96I24 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.231e-12■■■■□ 26.4
FUBP3Q96I24 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.681e-12■■■■□ 26.4
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 80.1 ms