Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREML1Q86YW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREML1Q86YW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TREML1Q86YW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TREML1Q86YW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms