Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TREML1Q86YW5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TREML1Q86YW5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TREML1Q86YW5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TREML1Q86YW5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TREML1Q86YW5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TREML1Q86YW5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TREML1Q86YW5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TREML1Q86YW5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TREML1Q86YW5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TREML1Q86YW5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TREML1Q86YW5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TREML1Q86YW5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TREML1Q86YW5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TREML1Q86YW5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TREML1Q86YW5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TREML1Q86YW5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TREML1Q86YW5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TREML1Q86YW5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TREML1Q86YW5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TREML1Q86YW5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TREML1Q86YW5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TREML1Q86YW5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TREML1Q86YW5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TREML1Q86YW5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TREML1Q86YW5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TREML1Q86YW5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TREML1Q86YW5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TREML1Q86YW5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TREML1Q86YW5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TREML1Q86YW5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TREML1Q86YW5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TREML1Q86YW5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TREML1Q86YW5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TREML1Q86YW5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TREML1Q86YW5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TREML1Q86YW5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TREML1Q86YW5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TREML1Q86YW5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TREML1Q86YW5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TREML1Q86YW5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TREML1Q86YW5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TREML1Q86YW5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TREML1Q86YW5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TREML1Q86YW5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TREML1Q86YW5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TREML1Q86YW5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TREML1Q86YW5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TREML1Q86YW5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TREML1Q86YW5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TREML1Q86YW5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TREML1Q86YW5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREML1Q86YW5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREML1Q86YW5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TREML1Q86YW5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TREML1Q86YW5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TREML1Q86YW5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TREML1Q86YW5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TREML1Q86YW5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TREML1Q86YW5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TREML1Q86YW5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TREML1Q86YW5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TREML1Q86YW5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TREML1Q86YW5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TREML1Q86YW5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TREML1Q86YW5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TREML1Q86YW5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TREML1Q86YW5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TREML1Q86YW5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML1Q86YW5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TREML1Q86YW5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TREML1Q86YW5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TREML1Q86YW5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TREML1Q86YW5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TREML1Q86YW5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TREML1Q86YW5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML1Q86YW5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML1Q86YW5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TREML1Q86YW5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TREML1Q86YW5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TREML1Q86YW5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TREML1Q86YW5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TREML1Q86YW5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML1Q86YW5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TREML1Q86YW5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TREML1Q86YW5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TREML1Q86YW5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TREML1Q86YW5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TREML1Q86YW5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TREML1Q86YW5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TREML1Q86YW5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms