Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF8P28908 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFRSF8P28908 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFRSF8P28908 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF8P28908 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF8P28908 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms