Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
HRCP23327 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
HRCP23327 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
HRCP23327 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
HRCP23327 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
HRCP23327 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
HRCP23327 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
HRCP23327 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HRCP23327 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HRCP23327 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HRCP23327 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
HRCP23327 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HRCP23327 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
HRCP23327 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
HRCP23327 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
HRCP23327 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
HRCP23327 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
HRCP23327 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HRCP23327 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HRCP23327 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HRCP23327 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HRCP23327 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HRCP23327 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HRCP23327 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
HRCP23327 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HRCP23327 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
HRCP23327 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
HRCP23327 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
HRCP23327 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
HRCP23327 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HRCP23327 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HRCP23327 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
HRCP23327 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
HRCP23327 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
HRCP23327 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
HRCP23327 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
HRCP23327 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.82■■■■□ 3.8
HRCP23327 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
HRCP23327 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
HRCP23327 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
HRCP23327 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
HRCP23327 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
HRCP23327 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
HRCP23327 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HRCP23327 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HRCP23327 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HRCP23327 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HRCP23327 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HRCP23327 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
HRCP23327 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HRCP23327 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HRCP23327 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HRCP23327 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
HRCP23327 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HRCP23327 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HRCP23327 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HRCP23327 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HRCP23327 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HRCP23327 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
HRCP23327 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
HRCP23327 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
HRCP23327 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
HRCP23327 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
HRCP23327 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
HRCP23327 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
HRCP23327 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
HRCP23327 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
HRCP23327 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HRCP23327 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HRCP23327 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HRCP23327 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HRCP23327 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HRCP23327 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
HRCP23327 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
HRCP23327 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
HRCP23327 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
HRCP23327 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
HRCP23327 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
HRCP23327 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
HRCP23327 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
HRCP23327 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
HRCP23327 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
HRCP23327 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
HRCP23327 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
HRCP23327 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
HRCP23327 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
HRCP23327 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
HRCP23327 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
HRCP23327 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
HRCP23327 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
HRCP23327 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
HRCP23327 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HRCP23327 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
HRCP23327 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HRCP23327 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HRCP23327 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HRCP23327 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
HRCP23327 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HRCP23327 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
HRCP23327 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms