Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYL1P12980 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYL1P12980 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYL1P12980 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYL1P12980 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYL1P12980 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYL1P12980 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LYL1P12980 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYL1P12980 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYL1P12980 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYL1P12980 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYL1P12980 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LYL1P12980 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LYL1P12980 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYL1P12980 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYL1P12980 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LYL1P12980 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYL1P12980 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LYL1P12980 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LYL1P12980 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYL1P12980 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYL1P12980 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYL1P12980 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LYL1P12980 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYL1P12980 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYL1P12980 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYL1P12980 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYL1P12980 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LYL1P12980 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYL1P12980 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYL1P12980 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYL1P12980 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYL1P12980 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LYL1P12980 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LYL1P12980 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYL1P12980 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LYL1P12980 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYL1P12980 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYL1P12980 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYL1P12980 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYL1P12980 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LYL1P12980 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYL1P12980 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LYL1P12980 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYL1P12980 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYL1P12980 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LYL1P12980 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYL1P12980 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYL1P12980 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYL1P12980 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYL1P12980 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LYL1P12980 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYL1P12980 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYL1P12980 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYL1P12980 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYL1P12980 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYL1P12980 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYL1P12980 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LYL1P12980 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LYL1P12980 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYL1P12980 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYL1P12980 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LYL1P12980 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYL1P12980 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYL1P12980 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LYL1P12980 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYL1P12980 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYL1P12980 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYL1P12980 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LYL1P12980 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LYL1P12980 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYL1P12980 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYL1P12980 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYL1P12980 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LYL1P12980 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LYL1P12980 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYL1P12980 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYL1P12980 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms