Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LYL1P12980 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LYL1P12980 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LYL1P12980 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYL1P12980 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LYL1P12980 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LYL1P12980 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LYL1P12980 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LYL1P12980 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LYL1P12980 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LYL1P12980 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LYL1P12980 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LYL1P12980 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LYL1P12980 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LYL1P12980 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LYL1P12980 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LYL1P12980 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LYL1P12980 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LYL1P12980 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LYL1P12980 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LYL1P12980 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LYL1P12980 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LYL1P12980 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LYL1P12980 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LYL1P12980 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LYL1P12980 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LYL1P12980 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LYL1P12980 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LYL1P12980 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYL1P12980 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYL1P12980 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LYL1P12980 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYL1P12980 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LYL1P12980 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYL1P12980 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYL1P12980 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYL1P12980 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYL1P12980 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYL1P12980 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LYL1P12980 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYL1P12980 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYL1P12980 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYL1P12980 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYL1P12980 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYL1P12980 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYL1P12980 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYL1P12980 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYL1P12980 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYL1P12980 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYL1P12980 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYL1P12980 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYL1P12980 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYL1P12980 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYL1P12980 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYL1P12980 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYL1P12980 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYL1P12980 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LYL1P12980 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYL1P12980 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LYL1P12980 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LYL1P12980 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYL1P12980 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYL1P12980 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYL1P12980 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYL1P12980 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LYL1P12980 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYL1P12980 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYL1P12980 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYL1P12980 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYL1P12980 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYL1P12980 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYL1P12980 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYL1P12980 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYL1P12980 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYL1P12980 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYL1P12980 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LYL1P12980 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYL1P12980 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYL1P12980 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYL1P12980 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYL1P12980 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYL1P12980 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYL1P12980 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYL1P12980 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYL1P12980 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYL1P12980 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYL1P12980 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYL1P12980 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYL1P12980 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYL1P12980 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYL1P12980 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LYL1P12980 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYL1P12980 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYL1P12980 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYL1P12980 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYL1P12980 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYL1P12980 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYL1P12980 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYL1P12980 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LYL1P12980 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 376.4 ms