Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ZZEF1O43149 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZZEF1O43149 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZZEF1O43149 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZZEF1O43149 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms