Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C9orf170A2RU37 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C9orf170A2RU37 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf170A2RU37 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms