Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC26A0AVF1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC26A0AVF1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC26A0AVF1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC26A0AVF1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC26A0AVF1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms