RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA FAP1P53971 965 aa15.54■□□□□ 0.08
15S_rRNA15S_rRNA PRY3P47033 881 aa14.7□□□□□ -0.06
15S_rRNA15S_rRNA MTC1P47018 478 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
15S_rRNA15S_rRNA YCK3P39962 524 aa13.78□□□□□ -0.2
15S_rRNA15S_rRNA HAA1Q12753 694 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
15S_rRNA15S_rRNA AAD16Q02895 342 aa13.6□□□□□ -0.23
15S_rRNA15S_rRNA PRI1P10363 409 aa13.39□□□□□ -0.27
15S_rRNA15S_rRNA TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
15S_rRNA15S_rRNA ISW2Q08773 1120 aa12.4□□□□□ -0.42
15S_rRNA15S_rRNA RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
15S_rRNA15S_rRNA DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
15S_rRNA15S_rRNA YGL015CP33199 130 aa12.18□□□□□ -0.46
15S_rRNA15S_rRNA BUD31P25337 157 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
15S_rRNA15S_rRNA MRPL32P25348 183 aa12.07□□□□□ -0.48
15S_rRNA15S_rRNA SIS1P25294 352 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
15S_rRNA15S_rRNA CDC27P38042 758 aa11.06□□□□□ -0.64
15S_rRNA15S_rRNA MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
15S_rRNA15S_rRNA UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
15S_rRNA15S_rRNA UBP9P39967 754 aa10.94□□□□□ -0.66
15S_rRNA15S_rRNA RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
15S_rRNA15S_rRNA REB1P21538 810 aa10.87□□□□□ -0.67
15S_rRNA15S_rRNA DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
15S_rRNA15S_rRNA RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
15S_rRNA15S_rRNA RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
15S_rRNA15S_rRNA TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
15S_rRNA15S_rRNA TGL3P40308 642 aa10.56□□□□□ -0.72
15S_rRNA15S_rRNA YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
15S_rRNA15S_rRNA SCY1P53009 804 aa10.36□□□□□ -0.75
15S_rRNA15S_rRNA SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
15S_rRNA15S_rRNA DCD1P06773 312 aa10.33□□□□□ -0.76
15S_rRNA15S_rRNA AVT3P36062 692 aa10.32□□□□□ -0.76
15S_rRNA15S_rRNA HOP09932 586 aa10.29□□□□□ -0.76
15S_rRNA15S_rRNA TFC8Q12308 588 aa10.24□□□□□ -0.77
15S_rRNA15S_rRNA YBL029C-AQ3E756 94 aa10.1□□□□□ -0.79
15S_rRNA15S_rRNA SPT21P35209 758 aa10.04□□□□□ -0.8
15S_rRNA15S_rRNA BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
15S_rRNA15S_rRNA YJL171CP46992 396 aa9.87□□□□□ -0.83
15S_rRNA15S_rRNA VNX1P42839 908 aa9.85□□□□□ -0.83
15S_rRNA15S_rRNA MST1P07236 462 aa9.83□□□□□ -0.84
15S_rRNA15S_rRNA BCH2P36122 765 aa9.83□□□□□ -0.84
15S_rRNA15S_rRNA AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
15S_rRNA15S_rRNA SPP1Q03012 353 aa9.78□□□□□ -0.84
15S_rRNA15S_rRNA YOR238WQ08634 303 aa9.71□□□□□ -0.85
15S_rRNA15S_rRNA FKH1P40466 484 aa9.68□□□□□ -0.86
15S_rRNA15S_rRNA WSC3Q12215 556 aa9.61□□□□□ -0.87
15S_rRNA15S_rRNA BMT6Q12291 365 aa9.52□□□□□ -0.89
15S_rRNA15S_rRNA TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
15S_rRNA15S_rRNA BDF1P35817 686 aa9.44□□□□□ -0.9
15S_rRNA15S_rRNA EPS1P40557 701 aa9.42□□□□□ -0.9
15S_rRNA15S_rRNA RIM101P33400 625 aa9.38□□□□□ -0.91
15S_rRNA15S_rRNA LDB19Q12502 818 aa9.38□□□□□ -0.91
15S_rRNA15S_rRNA NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.38□□□□□ -0.91not detected
15S_rRNA15S_rRNA YAP5P40574 245 aa9.31□□□□□ -0.92
15S_rRNA15S_rRNA RGA2Q06407 1009 aa9.27□□□□□ -0.93
15S_rRNA15S_rRNA ULI1P43604 169 aa9.25□□□□□ -0.93
15S_rRNA15S_rRNA IOC2Q12072 812 aa9.24□□□□□ -0.93
15S_rRNA15S_rRNA GTT3P39996 337 aa9.21□□□□□ -0.93
15S_rRNA15S_rRNA OXP1P28273 1286 aa9.08□□□□□ -0.96
15S_rRNA15S_rRNA RTG1P32607 177 aa9□□□□□ -0.97
15S_rRNA15S_rRNA BCK2P33306 851 aa8.99□□□□□ -0.97
15S_rRNA15S_rRNA NCR1Q12200 1170 aa8.99□□□□□ -0.97
15S_rRNA15S_rRNA YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
15S_rRNA15S_rRNA PTP3P40048 928 aa8.94□□□□□ -0.98
15S_rRNA15S_rRNA EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
15S_rRNA15S_rRNA PIB1Q06651 286 aa8.87□□□□□ -0.99
15S_rRNA15S_rRNA MSB4Q12317 492 aa8.85□□□□□ -0.99
15S_rRNA15S_rRNA BBC1P47068 1157 aa8.84□□□□□ -0.99
15S_rRNA15S_rRNA TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
15S_rRNA15S_rRNA SEC61P32915 480 aa8.8□□□□□ -1
15S_rRNA15S_rRNA RSM7P47150 247 aa8.8□□□□□ -1
15S_rRNA15S_rRNA RGA1P39083 1007 aa8.8□□□□□ -1
15S_rRNA15S_rRNA YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
15S_rRNA15S_rRNA AI2P03876 854 aa8.76□□□□□ -1.01
15S_rRNA15S_rRNA YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
15S_rRNA15S_rRNA CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
15S_rRNA15S_rRNA SET4P42948 560 aa8.73□□□□□ -1.01
15S_rRNA15S_rRNA SAP30P38429 201 aa8.72□□□□□ -1.01
15S_rRNA15S_rRNA TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
15S_rRNA15S_rRNA TFA1P36100 482 aa8.69□□□□□ -1.02
15S_rRNA15S_rRNA YOL036WQ08206 761 aa8.69□□□□□ -1.02
15S_rRNA15S_rRNA PRE3P38624 215 aa8.62□□□□□ -1.03
15S_rRNA15S_rRNA XDJ1P39102 459 aa8.62□□□□□ -1.03
15S_rRNA15S_rRNA DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
15S_rRNA15S_rRNA YLR271WQ06152 274 aa8.57□□□□□ -1.04
15S_rRNA15S_rRNA VRP1P37370 817 aa8.55□□□□□ -1.04
15S_rRNA15S_rRNA YDL129WQ07555 291 aa8.53□□□□□ -1.04
15S_rRNA15S_rRNA DAN4P47179 1161 aa8.48□□□□□ -1.05
15S_rRNA15S_rRNA PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
15S_rRNA15S_rRNA MRM1P25270 412 aa8.43□□□□□ -1.06
15S_rRNA15S_rRNA SRC1Q03707 834 aa8.41□□□□□ -1.06
15S_rRNA15S_rRNA JIP4Q03361 876 aa8.4□□□□□ -1.07
15S_rRNA15S_rRNA SSP1P38871 571 aa8.33□□□□□ -1.08
15S_rRNA15S_rRNA ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.31□□□□□ -1.08not detected
15S_rRNA15S_rRNA VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
15S_rRNA15S_rRNA SAM3Q08986 587 aa8.3□□□□□ -1.08
15S_rRNA15S_rRNA YDR344CQ05510 147 aa8.29□□□□□ -1.08
15S_rRNA15S_rRNA DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
15S_rRNA15S_rRNA CST9Q06032 482 aa8.25□□□□□ -1.09
15S_rRNA15S_rRNA VPS29P38759 282 aa8.24□□□□□ -1.09
15S_rRNA15S_rRNA YFR006WP43590 535 aa8.24□□□□□ -1.09
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